AtlasGenas
RNU6ATAC
RNA, U6atac small nuclear
- HGNC 34017↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000221676↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 100151684↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 9q34.2
- Koordinatės
- Chromosoma 9: 134 164 439–134 164 564 (GRCh38)
- Eksonai
- 1 eksonas per 0,1 kb
- Taip pat žinomas kaip
- RNU6ATAC1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000408749.1NR_023344.2
- Lokuso tipas
- Mažosios branduolio RNR (snRNR)
AtlasŠi puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu6atac.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite RNU6ATAC ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito RNU6ATAC geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.
Kaip išdėstytas RNU6ATAC
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 0,1 kb iš 0,1 kb geno.
RNU6ATAC sekvenavimas
24Vidutiniška
Kaip sunku sekvenuoti RNU6ATAC trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Dalis RNU6ATAC eksonų yra vietose, kur trumpieji skaitiniai gali praleisti arba neteisingai susieti pakeitimą.
Dar prisideda: kiekvienos rūšies sunkių sričių dalis tarp RNU6ATAC eksonų
- AtvaizduojamumasRuožai, kur 100 ar 250 bp skaitiniai negali būti vienareikšmiškai susieti, todėl ten iškvietimas gali būti praleistas arba klaidingas. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 100 balų.22 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kitose genomo vietose, pavyzdžiui, paralogai ir pseudogenai, kurių identiškumas 90 % ar didesnis. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 60 balų.0 %
- Bendra su chrYPseudoautosominiai regionai ir X perkelta sritis, kur chrX ir chrY turi tą pačią arba beveik tą pačią seką, todėl skaitinys iš vieno gali būti susietas su kitu. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 60 balų.0 %
- Nuorodinės sekos aprėptisNetoliese esantys spragos nuorodinėje sekoje, kur skaitiniams nėra su kuo lygiuotis. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 50 balų.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido ilgos sekos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neperdengti jų. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 30 balų.8,7 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %, bibliotekos paruošimo metu apimami menkai. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 20 balų.0 %
„Dante Labs“ rezultatas, sudarytas remiantis mūsų pačių tyrimais ir NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamaKiekvienas stulpelis rodo RNU6ATAC eksonų bazių dalį tos rūšies sunkioje srityje. Bet kuri viena rūšis gali pati savaime padaryti geną sunkiai sekvenuojamu, o kiekviena papildoma rūšis prideda vis mažiau: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai kiekviena bazė yra vietoje, kur skaitiniai negali būti vienareikšmiškai susieti.
Savybės, susijusios su RNU6ATAC
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti RNU6ATAC, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the immune system
- Asthma
- Baby eczema
- Combined immunodeficiency
- Eczema
- Infection in blood stream
- Recurrent chest infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent sinus and lung infections
Rodyti dar 2 savybių
Abnormality of the digestive system
- Abdominal pain
- Chronic constipation
- Colonic eosinophilia
- Diarrhea
- Fat in feces
- Feeding difficulties
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Jaundice
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). RNU6ATAC genas: RNA, U6atac small nuclear. Pasiekta 2026 m. spalio 20 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/rnu6atac
Dante Labs. RNU6ATAC genas: RNA, U6atac small nuclear [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 20 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/rnu6atac
AtlasVienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites