Genas
AP1B1
adaptor related protein complex 1 subunit beta 1
- HGNC 554↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000100280↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 162↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 22q12.2
- Koordinatės
- Chromosoma 22: 29 327 680–29 388 570 (GRCh38)
- Eksonai
- 23 eksonų per 60,9 kb
- Baltymas
- 949 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- BAM22, AP105A
- Ankstesni simboliai
- ADTB1, CLAPB2
- MANE Select transkriptas
- ENST00000357586.7NM_001127.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite AP1B1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Nasljedne palmoplantarinės keratodermijos ir pachyonychia congenita
- Nasljedinė palmoplantarinė keratodermija
Paveldimas delnų ir pėdų pado sustorėjimas, įskaitant pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashima tipo ir Bothnia tipo keratodermijas, keratitas-ichtiozė-kurtumo sindromą bei su CTSC susijusius Papillon-Lefèvre ir Haim-Munk sindromus.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Diagnozė padeda pasirūpinti pėdomis ir kontroliuoti skausmą; su CTSC susijusių formų atveju ankstyvas stomatologinis gydymas apsaugo dantis, o su GJB2 susijusių formų atveju rekomenduojama patikrinti klausą.
Kaip išdėstytas AP1B1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,2 kb iš 60,9 kb geno; 2 850 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito AP1B1
2
AP1B1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 1 (50 %) patenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (1 vieta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (1 vieta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 60,9 kb AP1B1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 4,2 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- AAGABalpha and gamma adaptin binding proteinTuri 1 bendrą būklę
- AQP5aquaporin 5Turi 1 bendrą būklę
- CTSCcathepsin CTuri 1 bendrą būklę
- DSG1desmoglein 1Turi 1 bendrą būklę
- DSPdesmoplakinTuri 1 bendrą būklę
- GJA1gap junction protein alpha 1Turi 1 bendrą būklę
- GJB2gap junction protein beta 2Turi 1 bendrą būklę
- GJB3gap junction protein beta 3Turi 1 bendrą būklę
- GJB4gap junction protein beta 4Turi 1 bendrą būklę
- GJB6gap junction protein beta 6Turi 1 bendrą būklę
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Turi 1 bendrą būklę
- KDSR3-ketodihydrosphingosine reductaseTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su AP1B1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti AP1B1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). AP1B1 genas: adaptor related protein complex 1 subunit beta 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/ap1b1
Dante Labs. AP1B1 genas: adaptor related protein complex 1 subunit beta 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/ap1b1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites