동료 심사 완료 · Nature Communications · 2025
Cell line-matched reference enables high-precision functional genomics
이 연구는 실험에 사용한 세포주에 맞춘 참조 게놈이 시퀀싱 데이터 분석을 개선하는지 검증했습니다. 이를 위해 인간 세포주 RPE-1용 참조 게놈을 새로 만들었습니다. 맞춤형 참조 게놈은 유전체, 후성유전체, 전사체 분석과 CRISPR 유전자 편집의 정확도를 높였고, 센트로미어 전반에 걸친 해플로타입 특이적 차이를 드러냈습니다.
Corda et al.
이 연구는 실험에 사용한 세포주에 맞춘 참조 게놈이 시퀀싱 데이터 분석을 개선하는지 검증했습니다. 이를 위해 인간 세포주 RPE-1용 참조 게놈을 새로 만들었습니다. 맞춤형 참조 게놈은 유전체, 후성유전체, 전사체 분석과 CRISPR 유전자 편집의 정확도를 높였고, 센트로미어 전반에 걸친 해플로타입 특이적 차이를 드러냈습니다.
Dante Labs의 참여 내용
Dante Labs 생물정보학 팀의 Mattia Capulli는 이 논문의 공동 저자이며, 연구에 사용된 PacBio 장독 시퀀싱에 대한 접근 권한을 제공했습니다.
저자들은 또한 Dante Labs의 Riccardo Ottalevi, Riccardo Paone, Isabella Baldini, Juan Caceres, Noemi Di Sabatino에게 통찰, 공간, 자원을 아낌없이 공유해 주신 데 대해 감사의 뜻을 전합니다.
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