Gene
VPS45
vacuolar protein sorting 45 homolog
- HGNC 14579(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000136631(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 11311(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 1q21.2
- Coordinate
- Cromosoma 1: 150.067.776–150.145.329 (GRCh38)
- Esoni
- 15 esoni su 77,6 kb
- Proteina
- 570 amminoacidi
- Noto anche come
- h-vps45, H1
- Simboli precedenti
- VPS45B, VPS45A
- Trascritto MANE Select
- ENST00000644510.2NM_007259.5
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Neutropenia congenita grave
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di VPS45
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,3 kb dei 77,6 kb del gene; 1713 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge VPS45
15
posizioni in VPS45 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 77,6 kb di VPS45, introni inclusi, non solo i 2,3 kb di esoni.
Tratti collegati a VPS45
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che VPS45 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene VPS45: vacuolar protein sorting 45 homolog. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vps45
Dante Labs. Gene VPS45: vacuolar protein sorting 45 homolog [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vps45
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