Gene
VKORC1
vitamin K epoxide reductase complex subunit 1
- HGNC 23663↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000167397↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 79001↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 16p11.2
- Coordinate
- Cromosoma 16: 31.090.854–31.094.797 (GRCh38)
- Esoni
- 3 esoni su 3,9 kb
- Proteina
- 163 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Simboli precedenti
- VKCFD2
- Trascritto MANE Select
- ENST00000394975.3NM_024006.6
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Carenze ereditarie rare dei fattori della coagulazione
- Carenze congenite dei fattori della coagulazione dipendenti dalla vitamina KAutosomica recessiva
Carenze ereditarie di protrombina (fattore II), fattore VII o fattore X, oppure di tutti i fattori dipendenti dalla vitamina K insieme (causate da alterazioni di GGCX o VKORC1), che possono provocare epistassi, facili lividi e sanguinamento dopo traumi, interventi chirurgici o parto.
- ClinGen valuta il legame come moderato
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere in anticipo la condizione consente di pianificare la sostituzione del fattore in vista di interventi chirurgici e del parto; la forma combinata spesso risponde alla vitamina K.
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
VKORC1 e farmaci
Sensibilità a warfarin
Farmacogenomica
VKORC1 è il bersaglio diretto di warfarin. L'allele del promotore -1639A riduce l'espressione di VKORC1, pertanto è necessaria una quantità inferiore di warfarin per ottenere lo stesso effetto.
- Rilevante solo in caso di prescrizione di un anticoagulante cumarinico; da valutare congiuntamente a CYP2C9.
- Lo stesso allele riduce la dose necessaria di acenocoumarol e phenprocoumon, i cumarinici più ampiamente utilizzati rispetto a warfarin in diverse aree d'Europa.
Alleli che il report analizza
- rs9923231 reference (C)
- rs9923231 variant (T)
Farmaco Livello CPIC Linea guida warfarin A CYP2C9, VKORC1, CYP4F2 and Warfarin
Struttura di VKORC1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 0,8 kb dei 3,9 kb del gene; 492 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge VKORC1
2
posizioni in VKORC1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 3,9 kb di VKORC1, introni inclusi, non solo i 0,8 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
Tratti collegati a VKORC1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che VKORC1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Decreased level of heparin co-factor II
- Prolonged partial thromboplastin time
- Prolonged prothrombin time
- Reduced factor IX activity
- Reduced factor VII activity
- Reduced factor X activity
Mostra altri 15 tratti
- Reduced protein C activity
- Reduced protein S activity
- Abnormally heavy bleeding during menstruation
- Bleeding post-delivery
- Bleeding within a joint
- Bleeding within the skull
- Bloody nose
- Cephalohematoma
- Ecchymosis
- Prolonged bleeding following circumcision
- Prolonged bleeding following procedure
- Abnormal umbilical stump bleeding
- Gastrointestinal bleeding
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Reduced prothrombin antigen
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- CPIC e PharmGKB: gli alleli, i risultati e i farmaci.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
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Dante Labs. (s.d.). Gene VKORC1: vitamin K epoxide reductase complex subunit 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vkorc1
Dante Labs. Gene VKORC1: vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vkorc1
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