Gene
PTPRO
protein tyrosine phosphatase receptor type O
- HGNC 9678(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000151490(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 5800(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 12p12.3
- Coordinate
- Cromosoma 12: 15.322.508–15.598.331 (GRCh38)
- Esoni
- 27 esoni su 275,8 kb
- Proteina
- 1216 amminoacidi
- Noto anche come
- PTPU2, GLEPP1, PTP-U2, PTP-oc, NPHS6
- Trascritto MANE Select
- ENST00000281171.9NM_030667.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Sindrome nefrosica
- Nefrosi
Processi patologici a carico del RENE privi di componenti infiammatorie o neoplastiche. La nefrosi può essere un disturbo primario o una complicanza secondaria di altre patologie. È caratterizzata dalla SINDROME NEFROSICA, che indica la presenza di PROTEINURIA e IPOALBUMINEMIA accompagnate da EDEMA.
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di PTPRO
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 6,1 kb dei 275,8 kb del gene; 3651 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge PTPRO
3
posizioni in PTPRO in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 275,8 kb di PTPRO, introni inclusi, non solo i 6,1 kb di esoni.
Tratti collegati a PTPRO
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PTPRO può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene PTPRO: protein tyrosine phosphatase receptor type O. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ptpro
Dante Labs. Gene PTPRO: protein tyrosine phosphatase receptor type O [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ptpro
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