Gène
ZNF292
zinc finger protein 292
- HGNC 18410↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000188994↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 23036↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 6q14.3
- Coordonnées
- Chromosome 6 : 87 155 565–87 265 943 (GRCh38)
- Exons
- 8 exons sur 110,4 kb
- Protéine
- 2 723 acides aminés
- Aussi appelé
- KIAA0530, ZFP292, bA393I2.3, Zn-15, Zn-16
- Transcrit MANE Select
- ENST00000369577.8NM_015021.3
- Type de locus
- Codant pour une protéine
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Déficience intellectuelle
L'un des 233 gènes qui lui sont liés
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Structure de ZNF292
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 12,3 kb sur les 110,4 kb du gène ; 8 172 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de ZNF292
1Facile
Difficulté de séquençage de ZNF292 avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de ZNF292 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.
Ce qui s'y ajoute : la part des exons de ZNF292 dans chaque type de zone difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, un appel effectué à cet endroit pouvant donc être manquant ou erroné. Poids 35 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 30 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles risquent de ne pas couvrir entièrement. Poids 15 %.3,6 %
- Teneur en GCFenêtres contenant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 10 %.8,2 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 10 %.0 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de ZNF292 situées dans ce type de zone difficile. Un seul type peut suffire à rendre un gène difficile à analyser, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une zone de ce type, 100 lorsque chaque base se trouve dans une zone où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
51
positions de ZNF292 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une zone que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 110,4 kb de ZNF292, introns compris, et pas seulement les 12,3 kb d'exons.
ClinVar pathogenic variants (52)
The ZNF292 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogène 18
- Pathogène/probablement pathogène 2
- Probablement pathogène 32
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NM_015021.3(ZNF292):c.6279dup (p.Arg2094fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_015021.3(ZNF292):c.265C>T (p.Arg89Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 and 1 other | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_015021.3(ZNF292):c.6160_6161del (p.Glu2054fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 and 2 others | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_015021.3(ZNF292):c.1414G>T (p.Glu472Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.1717del (p.Ile573fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.2966_2967del (p.Arg989fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.3066_3069del (p.Glu1022fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 and 1 other | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.3260dup (p.Ser1088fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.3432_3436del (p.Asn1144fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.3915dup (p.Asn1306Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.4098G>A (p.Trp1366Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.4282_4283del (p.Ser1428fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.4450C>T (p.Gln1484Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.4789C>T (p.Gln1597Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.4839_4840del (p.Asn1614fs) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.5233C>T (p.Gln1745Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.5950_5956del (p.Ile1984fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.6145dup (p.Ser2049fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 and 1 other | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.6239_6240del (p.Arg2080fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.6266_6269del (p.Lys2089fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.61G>C (p.Glu21Gln) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.467_468del (p.Gln156fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.814G>A (p.Ala272Thr) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.870C>A (p.Tyr290Ter) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
| NM_015021.3(ZNF292):c.1579_1580del (p.Arg527fs) (opens in a new tab) | intellectual developmental disorder, autosomal dominant 64 | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
See all 52 with every other ZNF292 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gènes liés aux mêmes affections
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Partage 1 affection
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- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxPartage 1 affection
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- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Partage 1 affection
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- ARID1AAT-rich interaction domain 1APartage 1 affection
Traits associés à ZNF292
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que ZNF292 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-18 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.18-8b139e39.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène ZNF292 : zinc finger protein 292. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/znf292
Dante Labs. Gène ZNF292 : zinc finger protein 292 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/znf292
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