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Gène

PDPN

podoplanin

Résumé

Localisation cytogénétique
1p36.21
Coordonnées
Chromosome 1 : 13 583 832–13 617 957 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 34,1 kb
Protéine
162 acides aminés
Aussi appelé
T1A-2, Gp38, aggrus, GP40, PA2.26, D2-40
Transcrit MANE Select
ENST00000621990.5NM_006474.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PDPN. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PDPN

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de PDPN. PDPN et 17 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 13 100 895 à 14 100 894.Chromosome 11p36.21p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4413,2 Mb13,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 MbHNRNPCL2 : 13 115 488–13 116 854, brin inverseHNRNPCL2PRAMEF26 : 13 148 905–13 158 116, brin inverseHNRNPCL4 : 13 163 914–13 165 631, brin inverseHNRNPCL4PRAMEF9 : 13 171 848–13 179 459, brin directPRAMEF9PRAMEF13 : 13 196 188–13 201 409, brin inversePRAMEF13PRAMEF18 : 13 222 695–13 226 154, brin inversePRAMEF18PRAMEF5 : 13 254 198–13 263 435, brin directPRAMEF5PRAMEF8 : 13 281 304–13 285 137, brin inversePRAMEF8PRAMEF33 : 13 303 539–13 308 907, brin directPRAMEF33PRAMEF15 : 13 315 581–13 322 598, brin directPRAMEF15PRAMEF14 : 13 341 892–13 347 134, brin inversePRAMEF14PRAMEF19 : 13 368 431–13 371 947, brin inversePRAMEF19PRAMEF17 : 13 389 632–13 392 629, brin directPRAMEF17PRAMEF20 : 13 410 450–13 421 328, brin directPRAMEF20LRRC38 : 13 474 973–13 514 526, brin inverseLRRC38PDPN : 13 583 832–13 617 957, brin directPDPNPRDM2 : 13 699 989–13 825 093, brin directPRDM2KAZN : 13 892 792–15 118 043, brin directKAZNSchéma de PDPN : 6 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 13 583 832–13 584 100, 269 basesExon 2 : 13 607 173–13 607 306, 134 basesExon 3 : 13 610 387–13 610 516, 130 basesExon 4 : 13 613 687–13 613 725, 39 basesExon 5 : 13 614 300–13 614 411, 112 basesExon 6 : 13 615 905–13 617 957, 2 053 bases1234565′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,7 kb sur les 34,1 kb du gène ; 489 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PDPN : podoplanin. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pdpn

Vancouver

Dante Labs. Gène PDPN : podoplanin [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pdpn

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