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Gène

APOC2

apolipoprotein C2

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.32
Coordonnées
Chromosome 19 : 44 946 051–44 949 565 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 3,5 kb
Protéine
101 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000252490.7NM_000483.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Structure de APOC2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de APOC2. APOC2 et 33 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 44 447 808 à 45 447 807.Chromosome 1919q13.32p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4344,6 Mb44,8 Mb45 Mb45,2 Mb45,4 MbZNF229 : 44 417 519–44 448 578, brin inverseZNF229ZNF180 : 44 470 957–44 500 547, brin inverseZNF180CEACAM20 : 44 501 677–44 529 788, brin inverseCEACAM20IGSF23 : 44 613 563–44 636 787, brin directIGSF23PVR : 44 643 798–44 666 162, brin directPVRCEACAM19 : 44 662 278–44 684 370, brin directCEACAM19CEACAM16 : 44 699 151–44 710 718, brin directCEACAM16BCL3 : 44 747 705–44 760 044, brin directBCL3CBLC : 44 777 845–44 802 301, brin directCBLCBCAM : 44 809 040–44 821 421, brin directBCAMNECTIN2 : 44 846 175–44 890 134, brin directNECTIN2TOMM40 : 44 890 569–44 903 695, brin directAPOE : 44 903 787–44 909 396, brin directAPOC1 : 44 913 133–44 920 054, brin directAPOC1APOC4 : 44 942 234–44 945 496, brin directAPOC4APOC4-APOC2 : 44 942 238–44 949 565, brin directAPOC4-APOC2APOC2 : 44 946 051–44 949 565, brin directAPOC2CLPTM1 : 44 954 585–44 993 342, brin directCLPTM1RELB : 45 001 431–45 038 194, brin directRELBCLASRP : 45 039 042–45 070 956, brin directCLASRPZNF296 : 45 071 500–45 076 485, brin inverseZNF296GEMIN7 : 45 075 575–45 091 518, brin directGEMIN7MARK4 : 45 079 288–45 305 284, brin directPPP1R37 : 45 091 396–45 148 077, brin directPPP1R37NKPD1 : 45 149 744–45 160 982, brin inverseNKPD1BLOC1S3 : 45 152 811–45 216 933, brin directBLOC1S3TRAPPC6A : 45 162 928–45 178 268, brin inverseTRAPPC6AEXOC3L2 : 45 210 600–45 245 429, brin inverseEXOC3L2CKM : 45 306 411–45 323 372, brin inverseCKMKLC3 : 45 333 434–45 351 537, brin directKLC3ERCC2 : 45 349 773–45 370 918, brin inverseERCC2PPP1R13L : 45 379 634–45 406 367, brin inversePPP1R13LPOLR1G : 45 406 644–45 410 737, brin directPOLR1GERCC1 : 45 407 333–45 479 055, brin inverseERCC1Schéma de APOC2 : 4 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 2 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 4 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 44 946 051–44 946 075, 25 basesExon 2 : 44 948 466–44 948 533, 68 basesExon 3 : 44 948 701–44 948 860, 160 basesExon 4 : 44 949 159–44 949 565, 407 bases12345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 0,7 kb sur les 3,5 kb du gène ; 306 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit APOC2

7

positions dans APOC2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 3,5 kb de APOC2, introns compris, et pas seulement les 0,7 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène APOC2 : apolipoprotein C2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/apoc2

Vancouver

Dante Labs. Gène APOC2 : apolipoprotein C2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/apoc2

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