Geeni
TACSTD2
tumor associated calcium signal transducer 2
- HGNC 11530↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000184292↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 4070↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1p32.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 58 575 433–58 577 252 (GRCh38)
- Eksonit
- 1 eksoni 1,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 323 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- TROP2, GA733-1, EGP-1
- Aiemmat symbolit
- M1S1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000371225.4NM_002353.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue TACSTD2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnölliset sarveiskalvon dystrofiat
- Sarveiskalvon dystrofia
Ryhmä perinnöllisiä sairauksia, jotka vaikuttavat yhteen tai useampaan sarveiskalvon kerrokseen. Niihin kuuluvat Fuchsin endoteelidystrofia (usein yhteydessä TCF4-toistojakson laajentumaan), TGFBI-geeniin liittyvät granulaarinen ja hilamainen dystrofia sekä harvinaisemmat tyypit, joita aiheuttavat geenit, kuten SLC4A11, COL8A2, ZEB1 ja CHST6.
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
TGFBI-varianttien kantajille suositellaan yleensä, että he välttävät laserilla tehtäviä taittovirhekorjauksia (LASIK tai PRK), koska ne voivat pahentaa kertymiä. Edennyt sairaus voidaan hoitaa sarveiskalvonsiirrolla, joka voi palauttaa näön.
TACSTD2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,8 kb geenin 1,8 kb:stä; 972 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä TACSTD2
2
TACSTD2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 1,8 kb geenistä TACSTD2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,8 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Yhteinen sairaus: 1
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainYhteinen sairaus: 1
- DCNdecorinYhteinen sairaus: 1
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Yhteinen sairaus: 1
- GSNgelsolinYhteinen sairaus: 1
- KRT12keratin 12Yhteinen sairaus: 1
- KRT3keratin 3Yhteinen sairaus: 1
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Yhteinen sairaus: 1
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Yhteinen sairaus: 1
- OVOL2ovo like zinc finger 2Yhteinen sairaus: 1
- PIKFYVEphosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containingYhteinen sairaus: 1
Geeniin TACSTD2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TACSTD2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TACSTD2-geeni: tumor associated calcium signal transducer 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tacstd2
Dante Labs. TACSTD2-geeni: tumor associated calcium signal transducer 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tacstd2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa