Gen
TACSTD2
tumor associated calcium signal transducer 2
- HGNC 11530↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000184292↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 4070↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 1p32.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 58 575 433–58 577 252 (GRCh38)
- Exoner
- 1 exon på 1,8 kb
- Protein
- 323 aminosyror
- Även känd som
- TROP2, GA733-1, EGP-1
- Tidigare symboler
- M1S1
- MANE Select-transkript
- ENST00000371225.4NM_002353.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs TACSTD2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Ärftliga hornhinnedystrofier
- Hornhinnedystrofi
En grupp ärftliga tillstånd som påverkar ett eller flera lager i hornhinnan, bland dem Fuchs endoteldystrofi (ofta kopplad till en expansion av en repetition i TCF4), TGFBI-relaterade granulär- och gittrig dystrofi samt ovanligare typer orsakade av gener som SLC4A11, COL8A2, ZEB1 och CHST6.
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Bärare av TGFBI-varianter rekommenderas i allmänhet att undvika lasерbaserad refraktiv kirurgi (LASIK eller PRK), eftersom den kan förvärra avlagringarna. Hornhinnetransplantation kan återställa synen vid avancerad sjukdom.
Så är TACSTD2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,8 kb av genens 1,8 kb, och 972 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest TACSTD2
2
positioner i TACSTD2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 1,8 kb av TACSTD2, med introner inräknade, inte bara de 1,8 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Delar 1 tillstånd
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainDelar 1 tillstånd
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainDelar 1 tillstånd
- DCNdecorinDelar 1 tillstånd
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Delar 1 tillstånd
- GSNgelsolinDelar 1 tillstånd
- KRT12keratin 12Delar 1 tillstånd
- KRT3keratin 3Delar 1 tillstånd
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Delar 1 tillstånd
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Delar 1 tillstånd
- OVOL2ovo like zinc finger 2Delar 1 tillstånd
- PIKFYVEphosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containingDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till TACSTD2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som TACSTD2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). TACSTD2-genen: tumor associated calcium signal transducer 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/tacstd2
Dante Labs. TACSTD2-genen: tumor associated calcium signal transducer 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/tacstd2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor