Geeni
SLC4A11
solute carrier family 4 member 11
- HGNC 16438↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000088836↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 83959↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 20p13
- Koordinaatit
- Kromosomi 20: 3 227 422–3 239 190 (GRCh38)
- Eksonit
- 20 eksonia 11,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 875 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- dJ794I6.2, BTR1, NaBC1, FECD4
- Aiemmat symbolit
- CHED2, CDPD1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000642402.1NM_001174089.2
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SLC4A11 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnölliset sarveiskalvon dystrofiat
- Sarveiskalvon dystrofia
Ryhmä perinnöllisiä sairauksia, jotka vaikuttavat yhteen tai useampaan sarveiskalvon kerrokseen. Niihin kuuluvat Fuchsin endoteelidystrofia (usein yhteydessä TCF4-toistojakson laajentumaan), TGFBI-geeniin liittyvät granulaarinen ja hilamainen dystrofia sekä harvinaisemmat tyypit, joita aiheuttavat geenit, kuten SLC4A11, COL8A2, ZEB1 ja CHST6.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
TGFBI-varianttien kantajille suositellaan yleensä, että he välttävät laserilla tehtäviä taittovirhekorjauksia (LASIK tai PRK), koska ne voivat pahentaa kertymiä. Edennyt sairaus voidaan hoitaa sarveiskalvonsiirrolla, joka voi palauttaa näön.
SLC4A11-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3 kb geenin 11,8 kb:stä; 2 628 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SLC4A11
99
SLC4A11-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 11,8 kb geenistä SLC4A11, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Yhteinen sairaus: 1
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainYhteinen sairaus: 1
- DCNdecorinYhteinen sairaus: 1
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Yhteinen sairaus: 1
- GSNgelsolinYhteinen sairaus: 1
- KRT12keratin 12Yhteinen sairaus: 1
- KRT3keratin 3Yhteinen sairaus: 1
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Yhteinen sairaus: 1
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Yhteinen sairaus: 1
- OVOL2ovo like zinc finger 2Yhteinen sairaus: 1
- PIKFYVEphosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containingYhteinen sairaus: 1
Geeniin SLC4A11 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SLC4A11 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SLC4A11-geeni: solute carrier family 4 member 11. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/slc4a11
Dante Labs. SLC4A11-geeni: solute carrier family 4 member 11 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/slc4a11
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa