Geen
NDUFAF4
NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 4
- HGNC 21034↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000123545↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 29078↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 6q16.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 6: 96 889 315–96 897 891 (GRCh38)
- Eksonid
- 3 eksonit, ulatus 8,6 kb
- Valk
- 175 aminohapet
- Tuntud ka kui
- HSPC125, bA22L21.1, My013, HRPAP20
- Varasemad tähised
- C6orf66
- MANE Select transkript
- ENST00000316149.8NM_014165.4
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ndufaf4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe NDUFAF4 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Primaarne mitokondriaalne haigus
- Mitokondriaalse hingamisahela kompleksi puudulikkus
Üks 61 sellega seotud geenist
Kompleksi I, II, III, IV või V isoleeritud puudulikkus, mida põhjustavad tuuma- või mitokondriaalsete geenide variandid. See võib mõjutada aju, lihaseid, südant, maksa ja teisi energiavajadusega elundeid.
- 2 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Teadmine võib lõpetada diagnoosiotsingu ning suunata mõjutatud elundite jälgimist ja mitokondritele toksiliste ravimite vältimist.
Kuidas NDUFAF4 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,4 kb kogupikkusega 8,6 kb; neist 528 alust kodeerivad valku.
NDUFAF4 sekveneerimine
29Mõõdukas
Kui raske on geeni NDUFAF4 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st
0 · Kerge100 · Raske
Osa geeni NDUFAF4 eksonitest asub kohtades, kus lühikesed lugemid võivad muutuse vahele jätta või valesti paigutada.
Mis seda veel suurendab: geeni NDUFAF4 eksonite osa igat tüüpi rasketes piirkondades
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal muutus puududa või olla vale. Kaal 35%.3%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: genoomis mujal asuvad koopiad, nagu paraloogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.86%
- KorduvusedTandemkorduvused ja ühe aluse jadad, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.4,5%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-aluseid on alla 25% või üle 65%; raamatukogu valmistamine katab neid nõrgalt. Kaal 10%.15%
- ReferentskatvusReferentskoostu lüngad lähedal, kus pole järjestust, millega lugemid joonduda saaks. Kaal 10%.0%
Dante Labsi skoor meie enda uurimistöö põhjal, mis tugineb NISTi Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavatest piirkondadest.Kuidas skoor arvutatakseIga riba näitab, kui suur osa geeni NDUFAF4 eksonite alustest jääb sellisesse raskesse piirkonda. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemite põhjal tehtavat tuvastust raskendab: 0, kui ükski alus ei asu ühessegi piirkonda, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
1
positsioon geenis NDUFAF4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ei jää ükski piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Kogu genoomi sekveneerimine katab kogu geeni NDUFAF4 8,6 kb, sealhulgas introneid, mitte ainult eksoneid (2,4 kb).
ClinVar pathogenic variants (1)
The NDUFAF4 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Tõenäoliselt patogeenne 1
| Variant | Conditions | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|
| NM_014165.4(NDUFAF4):c.7G>C (p.Ala3Pro) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 15 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
Samade haigustega seotud geenid
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Jagab 1 haigust
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaJagab 1 haigust
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaJagab 1 haigust
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonJagab 1 haigust
- BCS1LBCS1 ubiquinol-cytochrome c reductase complex chaperoneJagab 1 haigust
- COA6cytochrome c oxidase assembly factor 6Jagab 1 haigust
- COA8cytochrome c oxidase assembly factor 8Jagab 1 haigust
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Jagab 1 haigust
- COX15cytochrome c oxidase assembly factor COX15Jagab 1 haigust
- COX16cytochrome c oxidase assembly factor COX16Jagab 1 haigust
- COX20cytochrome c oxidase assembly factor COX20Jagab 1 haigust
- COX6B1cytochrome c oxidase subunit 6B1Jagab 1 haigust
Geeniga NDUFAF4 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida NDUFAF4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Generalized decreased muscle tone
- Low muscle tone
- Mitochondrial myopathy
- Muscle weakness
- Poor head control
- Flexed joint that cannot be straightened
- Hunched back
- Muscle tissue disease
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-18: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.18-8b139e39.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). NDUFAF4 geen: NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 4. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ndufaf4
Dante Labs. NDUFAF4 geen: NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 4 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ndufaf4
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast