Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

HDAC6

histone deacetylase 6

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
Xp11.23
Koordinaadid
Kromosoom X: 48 802 067–48 824 976 (GRCh38)
Eksonid
29 eksonit, ulatus 22,9 kb
Valk
1215 aminohapet
Tuntud ka kui
KIAA0901, JM21, HD6, FLJ16239, PPP1R90, KDAC6
MANE Select transkript
ENST00000334136.11NM_006044.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni HDAC6 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas HDAC6 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom X, millel on sulg kohal, kus asub HDAC6. HDAC6 ja sellele lähedal asuvad 40 geeni kromosoomil X, vahemikus 48 313 522 kuni 49 313 521.Kromosoom XXp11.23p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2848,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 MbSSX3: 48 337 725–48 356 750, pöördne ahelSSX3SSX4: 48 383 516–48 393 347, otsene ahelSSX4SSX4B: 48 402 082–48 411 960, pöördne ahelSSX4BSLC38A5: 48 458 536–48 470 554, pöördne ahelSLC38A5FTSJ1: 48 476 021–48 486 364, otsene ahelFTSJ1PORCN: 48 508 574–48 520 814, otsene ahelPORCNEBP: 48 521 089–48 528 716, otsene ahelEBP: 48 521 806–48 545 469, otsene ahelTBC1D25: 48 539 623–48 562 613, otsene ahelTBC1D25RBM3: 48 574 056–48 581 162, otsene ahelRBM3WDR13: 48 589 838–48 608 869, otsene ahelWDR13WAS: 48 676 593–48 691 431, otsene ahelWASSUV39H1: 48 695 554–48 709 556, otsene ahelSUV39H1GLOD5: 48 761 744–48 773 648, otsene ahelGLOD5GATA1: 48 783 122–48 794 311, otsene ahelGATA1HDAC6: 48 802 067–48 824 976, otsene ahelHDAC6ERAS: 48 826 513–48 830 138, otsene ahelERASPCSK1N: 48 831 088–48 835 632, pöördne ahelPCSK1NTIMM17B: 48 880 274–48 898 143, pöördne ahelTIMM17BPQBP1: 48 890 197–48 903 640, otsene ahelPQBP1SLC35A2: 48 903 180–48 911 958, pöördne ahelSLC35A2PIM2: 48 913 172–48 919 546, pöördne ahelPIM2OTUD5: 48 922 024–48 958 390, pöördne ahelKCND1: 48 960 982–48 971 916, pöördne ahelKCND1GRIPAP1: 48 973 719–49 002 265, pöördne ahelGRIPAP1TFE3: 49 028 726–49 043 512, pöördne ahelTFE3CCDC120: 49 053 463–49 073 357, otsene ahelCCDC120PRAF2: 49 070 107–49 074 022, pöördne ahelPRAF2: 49 071 470–49 079 887, pöördne ahelWDR45: 49 074 431–49 101 203, pöördne ahelWDR45GPKOW: 49 112 941–49 123 750, pöördne ahelGPKOWMAGIX: 49 162 564–49 169 931, otsene ahelMAGIXPLP2: 49 171 787–49 175 387, otsene ahelPLP2PRICKLE3: 49 174 802–49 186 528, pöördne ahelPRICKLE3SYP: 49 187 807–49 200 218, pöördne ahelSYPCACNA1F: 49 205 063–49 233 371, pöördne ahelCCDC22: 49 235 444–49 250 526, otsene ahelCCDC22FOXP3: 49 250 436–49 264 800, pöördne ahelFOXP3: 49 258 343–49 270 477, pöördne ahelPPP1R3F: 49 269 771–49 301 468, otsene ahelPPP1R3FGAGE10: 49 303 645–49 319 844, otsene ahelGAGE10HDAC6 skeem: 29 eksonit kromosoomi X otsene ahelalEkson 20: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 48 802 067–48 802 142, 76 alustEkson 2: 48 802 663–48 802 785, 123 alustEkson 3: 48 802 871–48 802 999, 129 alustEkson 4: 48 803 128–48 803 216, 89 alustEkson 5: 48 805 438–48 805 522, 85 alustEkson 6: 48 805 631–48 805 671, 41 alustEkson 7: 48 806 368–48 806 464, 97 alustEkson 8: 48 806 609–48 806 706, 98 alustEkson 9: 48 808 033–48 808 137, 105 alustEkson 10: 48 808 258–48 808 326, 69 alustEkson 11: 48 814 440–48 814 566, 127 alustEkson 12: 48 814 675–48 814 740, 66 alustEkson 13: 48 814 834–48 814 893, 60 alustEkson 14: 48 814 962–48 815 051, 90 alustEkson 15: 48 815 384–48 815 490, 107 alustEkson 16: 48 815 575–48 815 642, 68 alustEkson 17: 48 815 884–48 816 052, 169 alustEkson 18: 48 816 141–48 816 269, 129 alustEkson 19: 48 816 465–48 816 633, 169 alustEkson 20: 48 817 326–48 817 459, 134 alustEkson 21: 48 818 041–48 818 109, 69 alustEkson 22: 48 818 220–48 818 412, 193 alustEkson 23: 48 820 106–48 820 255, 150 alustEkson 24: 48 822 620–48 822 794, 175 alustEkson 25: 48 822 912–48 823 588, 677 alustEkson 26: 48 823 672–48 823 785, 114 alustEkson 27: 48 823 922–48 824 068, 147 alustEkson 28: 48 824 166–48 824 294, 129 alustEkson 29: 48 824 544–48 824 976, 433 alust1510152025295′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,1 kb kogupikkusega 22,9 kb; neist 3648 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse HDAC6

1

koht geenis HDAC6, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni HDAC6 22,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,1 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). HDAC6 geen: histone deacetylase 6. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/hdac6

Vancouver

Dante Labs. HDAC6 geen: histone deacetylase 6 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/hdac6

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test