Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

HDAC6

histone deacetylase 6

Sammanfattning

Cytogenetisk position
Xp11.23
Koordinater
Kromosom X: 48 802 067–48 824 976 (GRCh38)
Exoner
29 exoner på 22,9 kb
Protein
1 215 aminosyror
Även känd som
KIAA0901, JM21, HD6, FLJ16239, PPP1R90, KDAC6
MANE Select-transkript
ENST00000334136.11NM_006044.4
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser HDAC6 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är HDAC6 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom X, med en parentes där HDAC6 finns. HDAC6 och 40 gener i närheten på kromosom X, från 48 313 522 till 49 313 521.Kromosom XXp11.23p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2848,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 MbSSX3: 48 337 725–48 356 750, bakåt-strängSSX3SSX4: 48 383 516–48 393 347, framåt-strängSSX4SSX4B: 48 402 082–48 411 960, bakåt-strängSSX4BSLC38A5: 48 458 536–48 470 554, bakåt-strängSLC38A5FTSJ1: 48 476 021–48 486 364, framåt-strängFTSJ1PORCN: 48 508 574–48 520 814, framåt-strängPORCNEBP: 48 521 089–48 528 716, framåt-strängEBP: 48 521 806–48 545 469, framåt-strängTBC1D25: 48 539 623–48 562 613, framåt-strängTBC1D25RBM3: 48 574 056–48 581 162, framåt-strängRBM3WDR13: 48 589 838–48 608 869, framåt-strängWDR13WAS: 48 676 593–48 691 431, framåt-strängWASSUV39H1: 48 695 554–48 709 556, framåt-strängSUV39H1GLOD5: 48 761 744–48 773 648, framåt-strängGLOD5GATA1: 48 783 122–48 794 311, framåt-strängGATA1HDAC6: 48 802 067–48 824 976, framåt-strängHDAC6ERAS: 48 826 513–48 830 138, framåt-strängERASPCSK1N: 48 831 088–48 835 632, bakåt-strängPCSK1NTIMM17B: 48 880 274–48 898 143, bakåt-strängTIMM17BPQBP1: 48 890 197–48 903 640, framåt-strängPQBP1SLC35A2: 48 903 180–48 911 958, bakåt-strängSLC35A2PIM2: 48 913 172–48 919 546, bakåt-strängPIM2OTUD5: 48 922 024–48 958 390, bakåt-strängKCND1: 48 960 982–48 971 916, bakåt-strängKCND1GRIPAP1: 48 973 719–49 002 265, bakåt-strängGRIPAP1TFE3: 49 028 726–49 043 512, bakåt-strängTFE3CCDC120: 49 053 463–49 073 357, framåt-strängCCDC120PRAF2: 49 070 107–49 074 022, bakåt-strängPRAF2: 49 071 470–49 079 887, bakåt-strängWDR45: 49 074 431–49 101 203, bakåt-strängWDR45GPKOW: 49 112 941–49 123 750, bakåt-strängGPKOWMAGIX: 49 162 564–49 169 931, framåt-strängMAGIXPLP2: 49 171 787–49 175 387, framåt-strängPLP2PRICKLE3: 49 174 802–49 186 528, bakåt-strängPRICKLE3SYP: 49 187 807–49 200 218, bakåt-strängSYPCACNA1F: 49 205 063–49 233 371, bakåt-strängCCDC22: 49 235 444–49 250 526, framåt-strängCCDC22FOXP3: 49 250 436–49 264 800, bakåt-strängFOXP3: 49 258 343–49 270 477, bakåt-strängPPP1R3F: 49 269 771–49 301 468, framåt-strängPPP1R3FGAGE10: 49 303 645–49 319 844, framåt-strängGAGE10Diagram över HDAC6: 29 exoner på framåt-strängen av kromosom XExon 20: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 48 802 067–48 802 142, 76 baserExon 2: 48 802 663–48 802 785, 123 baserExon 3: 48 802 871–48 802 999, 129 baserExon 4: 48 803 128–48 803 216, 89 baserExon 5: 48 805 438–48 805 522, 85 baserExon 6: 48 805 631–48 805 671, 41 baserExon 7: 48 806 368–48 806 464, 97 baserExon 8: 48 806 609–48 806 706, 98 baserExon 9: 48 808 033–48 808 137, 105 baserExon 10: 48 808 258–48 808 326, 69 baserExon 11: 48 814 440–48 814 566, 127 baserExon 12: 48 814 675–48 814 740, 66 baserExon 13: 48 814 834–48 814 893, 60 baserExon 14: 48 814 962–48 815 051, 90 baserExon 15: 48 815 384–48 815 490, 107 baserExon 16: 48 815 575–48 815 642, 68 baserExon 17: 48 815 884–48 816 052, 169 baserExon 18: 48 816 141–48 816 269, 129 baserExon 19: 48 816 465–48 816 633, 169 baserExon 20: 48 817 326–48 817 459, 134 baserExon 21: 48 818 041–48 818 109, 69 baserExon 22: 48 818 220–48 818 412, 193 baserExon 23: 48 820 106–48 820 255, 150 baserExon 24: 48 822 620–48 822 794, 175 baserExon 25: 48 822 912–48 823 588, 677 baserExon 26: 48 823 672–48 823 785, 114 baserExon 27: 48 823 922–48 824 068, 147 baserExon 28: 48 824 166–48 824 294, 129 baserExon 29: 48 824 544–48 824 976, 433 baser1510152025295′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 4,1 kb av genens 22,9 kb, och 3 648 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av HDAC6

3Lätt

Hur svår HDAC6 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i HDAC6 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som adderar: andelen av HDAC6:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Repetitioner8,2 %
  • GC-innehåll15 %
  • Referenstäckning0 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

1

position i HDAC6 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen

Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

En helgenomsekvensering täcker alla 22,9 kb av HDAC6, inklusive introner, inte bara de 4,1 kb exoner.

ClinVar pathogenic variants (1)

The HDAC6 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.

  • Sannolikt patogen 1
VariantConditionsClinVar-klassificeringGranskningsstatus
NM_006044.4(HDAC6):c.1894C>T (p.His632Tyr) (opens in a new tab)X-linked dominant chondrodysplasia, Chassaing-Lacombe typeSannolikt patogen1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare

Egenskaper kopplade till HDAC6

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som HDAC6 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.17-8666dff2.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). HDAC6-genen: histone deacetylase 6. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/hdac6

Vancouver

Dante Labs. HDAC6-genen: histone deacetylase 6 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/hdac6

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test