Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

CDT1

chromatin licensing and DNA replication factor 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
16q24.3
Koordinaadid
Kromosoom 16: 88 803 789–88 809 258 (GRCh38)
Eksonid
10 eksonit, ulatus 5,5 kb
Valk
546 aminohapet
Tuntud ka kui
DUP, RIS2
MANE Select transkript
ENST00000301019.9NM_030928.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni CDT1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas CDT1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 16, millel on sulg kohal, kus asub CDT1. CDT1 ja sellele lähedal asuvad 20 geeni kromosoomil 16, vahemikus 88 306 524 kuni 89 306 523.Kromosoom 1616q24.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.388,4 Mb88,6 Mb88,8 Mb89 Mb89,2 MbZNF469: 88 382 959–88 440 757, otsene ahelZNF469ZFPM1: 88 453 208–88 537 031, otsene ahelZFPM1ZC3H18: 88 570 388–88 631 966, otsene ahelZC3H18IL17C: 88 638 571–88 640 468, otsene ahelIL17CCYBA: 88 643 275–88 651 083, pöördne ahelCYBAMVD: 88 651 934–88 663 166, pöördne ahelMVDSNAI3: 88 674 992–88 686 513, pöördne ahelSNAI3RNF166: 88 696 494–88 706 424, pöördne ahelRNF166CTU2: 88 706 470–88 717 853, otsene ahelCTU2PIEZO1: 88 715 338–88 785 251, pöördne ahelPIEZO1CDT1: 88 803 789–88 809 258, otsene ahelCDT1APRT: 88 808 323–88 811 970, pöördne ahelAPRTGALNS: 88 813 733–88 857 832, pöördne ahelGALNSTRAPPC2L: 88 856 220–88 862 686, otsene ahelTRAPPC2LPABPN1L: 88 863 333–88 866 660, pöördne ahelPABPN1LCBFA2T3: 88 874 858–88 977 207, pöördne ahelCBFA2T3ACSF3: 89 088 375–89 164 121, otsene ahelACSF3CDH15: 89 171 742–89 195 492, otsene ahelCDH15SLC22A31: 89 195 458–89 201 692, pöördne ahelSLC22A31ZNF778: 89 217 683–89 237 141, otsene ahelZNF778ANKRD11: 89 267 619–89 490 706, pöördne ahelANKRD11CDT1 skeem: 10 eksonit kromosoomi 16 otsene ahelalEkson 1: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 7: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 88 803 789–88 804 059, 271 alustEkson 2: 88 804 545–88 804 667, 123 alustEkson 3: 88 804 762–88 804 898, 137 alustEkson 4: 88 805 440–88 805 637, 198 alustEkson 5: 88 805 724–88 805 869, 146 alustEkson 6: 88 806 021–88 806 121, 101 alustEkson 7: 88 806 486–88 806 674, 189 alustEkson 8: 88 807 051–88 807 203, 153 alustEkson 9: 88 807 281–88 807 482, 202 alustEkson 10: 88 808 115–88 809 258, 1144 alust123456789105′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,7 kb kogupikkusega 5,5 kb; neist 1641 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse CDT1

8

kohad geenis CDT1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CDT1 5,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,7 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). CDT1 geen: chromatin licensing and DNA replication factor 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cdt1

Vancouver

Dante Labs. CDT1 geen: chromatin licensing and DNA replication factor 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cdt1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test