Gen
ZMYND10
zinc finger MYND-type containing 10
- HGNC 19412↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000004838↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 51364↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 3p21.31
- Souřadnice
- Chromozom 3: 50 341 112–50 345 732 (GRCh38)
- Exony
- 12 exonů na 4,6 kb
- Protein
- 440 aminokyselin
- Další názvy
- BLU, CILD22, DNAAF7
- Transkript MANE Select
- ENST00000231749.8NM_015896.4
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/zmynd10.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si ZMYND10 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Primary Ciliary Dyskinesia
- Autozomálně recesivní
A rare, genetically heterogeneous, primarily respiratory disorder characterized by chronic upper and lower respiratory tract disease. Approximately half of PCD patients have an organ laterality defect (situs inversus totalis or situs ambiguus/heterotaxy).
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 5 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je ZMYND10 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,8 kb z 4,6 kb genu; 1 323 těchto bází kódují protein.
Sekvenování ZMYND10
3Snadné
Jak obtížně se ZMYND10 sekvenuje krátkými čteními, ze 100
0 · Snadné100 · Obtížné
Téměř všechny exony genu ZMYND10 leží tam, kde se krátká čtení mapují čistě.
Co k tomu přispívá: podíl exonů genu ZMYND10 v každém druhu obtížné oblasti
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 100.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 60.0 %
- Sdíleno s chrYPseudoautozomální oblasti a oblast X-transponovaná, kde chrX a chrY nesou stejnou nebo téměř stejnou sekvenci, takže čtení z jednoho může být umístěno na druhém. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 60.0 %
- Pokrytí referenční sekvenceMezery v referenční sestavě v okolí, kde pro čtení není sekvence, na kterou by se mohla zarovnat. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 50.0 %
- RepeticeTandemové repetice a série jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přečíst celé. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 30.0 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, která příprava knihovny pokrývá řídce. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 20.15 %
Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítáKaždý sloupec udává podíl bází exonů genu ZMYND10 v daném druhu obtížné oblasti. Každý druh sám o sobě může gen učinit obtížným a každý další přidává méně: 0, pokud žádná báze nespadá do žádné z oblastí, 100, pokud každá báze leží tam, kde čtení nelze jednoznačně umístit.
32
pozic v ZMYND10, kde ClinVar řadí změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachytí.
Celogenomové sekvenování pokrývá všech 4,6 kb genu ZMYND10, včetně intronů, nejen 1,8 kb exonů.
ClinVar pathogenic variants (33)
The ZMYND10 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenní 23
- Pravděpodobně patogenní 10
| Varianta | Conditions | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|
| NM_015896.4(ZMYND10):c.183_187del (p.Leu62fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia and 1 other | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.47T>G (p.Val16Gly) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia and 1 other | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.1191C>A (p.Cys397Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.1096C>T (p.Gln366Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.1046G>A (p.Trp349Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.967C>T (p.Gln323Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.934_935del (p.Ser312fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 22 | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.931C>T (p.Gln311Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia and 1 other | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.797T>C (p.Leu266Pro) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia and 1 other | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.747del (p.Ser250fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 22 | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.732G>A (p.Trp244Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.709C>T (p.Gln237Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.700+2T>C (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 22 | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.510+1G>A (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.490C>T (p.Gln164Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia and 1 other | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.383_384del (p.Glu128fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.300del (p.Phe101fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.88G>T (p.Glu30Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.85T>C (p.Ser29Pro) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.76G>T (p.Glu26Ter) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.31del (p.Glu11fs) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 22 | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.3G>A (p.Met1Ile) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.1A>G (p.Met1Val) (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.1248-1G>T (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia 22 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_015896.4(ZMYND10):c.1121+1G>A (opens in a new tab) | primary ciliary dyskinesia | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
See all 33 with every other ZMYND10 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Geny spojené se stejnými onemocněními
- CCDC39coiled-coil domain 39 molecular ruler complex subunitSdílí 1 onemocnění
- CCDC40coiled-coil domain 40 molecular ruler complex subunitSdílí 1 onemocnění
- CCNOcyclin OSdílí 1 onemocnění
- CENPFcentromere protein FSdílí 1 onemocnění
- CFAP20DCCFAP20 domain containingSdílí 1 onemocnění
- CFAP221cilia and flagella associated protein 221Sdílí 1 onemocnění
- CFAP298cilia and flagella associated protein 298Sdílí 1 onemocnění
- CFAP300cilia and flagella associated protein 300Sdílí 1 onemocnění
- CFAP54cilia and flagella associated protein 54Sdílí 1 onemocnění
- CLXNcalaxinSdílí 1 onemocnění
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 1Sdílí 1 onemocnění
- DNAAF1dynein axonemal assembly factor 1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s ZMYND10
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit ZMYND10. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-19: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.19-9814e911.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ZMYND10: zinc finger MYND-type containing 10. Staženo 19. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/zmynd10
Dante Labs. Gen ZMYND10: zinc finger MYND-type containing 10 [Internet]. [citováno 19. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/zmynd10
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů