Gen
LMOD2
leiomodin 2
- HGNC 6648↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000170807↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 442721↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 7q31.32
- Koordinatlar
- Kromozom 7: 123.655.866–123.664.290 (GRCh38)
- Eksonlar
- 8,4 kb boyunca 3 ekson
- Protein
- 547 amino asit
- Diğer adları
- C-Lmod
- MANE Select transkripti
- ENST00000458573.3NM_207163.3
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/lmod2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLMOD2 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Dilate Kardiyomiyopati
Koroner arter veya kapak hastalığıyla açıklanamayan, sol ventrikülün genişleyip zayıflaması; kalıtsal formlar TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN ve diğer birçok genle ilişkilidir ve Barth sendromu ile Emery-Dreifuss kas distrofilerini içerir.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 5 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Genetik bir nedenin bilinmesi, kalp takibinin daha erken başlamasına ve aile taramasının yapılmasına destek olur. LMNA, FLNC ve RBM20 gibi yüksek aritmi riski taşıyan genler için ise ritim takibi ve implante edilebilir defibrilatör kararlarında yol gösterici olur.
LMOD2 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 8,4 kb uzunluğunun 2,3 kb'sini oluşturur; bu bazların 1.644 tanesi proteini kodlar.
LMOD2 dizilemesi
2Düşük
100 üzerinden, LMOD2 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, LMOD2 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%14
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%0
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
3
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir değişikliğin LMOD2 içindeki konumları
Bunlardan hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom, intronlar dahil, LMOD2 genin tamamı olan 8,4 kb'yi kapsar; yalnızca 2,3 kb'lik ekzonları değil.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ABCC9ATP binding cassette subfamily C member 91 durumu paylaşıyor
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 11 durumu paylaşıyor
- BAG3BAG cochaperone 31 durumu paylaşıyor
- BAG5BAG cochaperone 51 durumu paylaşıyor
- DESdesmin1 durumu paylaşıyor
- DMDdystrophin1 durumu paylaşıyor
- DOLKdolichol kinase1 durumu paylaşıyor
- EMDemerin1 durumu paylaşıyor
- FHL1four and a half LIM domains 11 durumu paylaşıyor
- FKTNfukutin1 durumu paylaşıyor
- FLIIFLII actin remodeling protein1 durumu paylaşıyor
- FLNCfilamin C1 durumu paylaşıyor
LMOD2 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, LMOD2 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-17 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.18-e609d43e.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). LMOD2 geni: leiomodin 2. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lmod2
Dante Labs. LMOD2 geni: leiomodin 2 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lmod2
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde