Gen
MALT1
MALT1 paracaspase
- HGNC 6819↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000172175↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 10892↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 18q21.32
- Współrzędne
- Chromosom 18: 58 671 465–58 754 477 (GRCh38)
- Eksony
- 17 eksonów na odcinku 83 kb
- Białko
- 824 aminokwasów
- Znany również jako
- PCASP1
- Poprzednie symbole
- MLT
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000649217.2NM_006785.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/malt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj MALT1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Inne wrodzone błędy odporności
- Niedobór odporności
Jeden z 170 powiązanych z nim genów
Choroba, w której dochodzi do niedoboru lub wady mechanizmów odporności, komórkowej lub humoralnej.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
HSCT w przypadku SCID i ciężkich pierwotnych niedoborów odporności; substytucja immunoglobulinami (IVIG/SCIG) w przypadku niedoborów przeciwciał; leniolisib (Joenja, FDA 2023) w APDS; terapia genowa w ADA-SCID; abatacept w niedoborze CTLA4/LRBA; profilaktyczne antybiotyki; G-CSF w CGD
Budowa genu MALT1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 9,3 kb z 83 kb genu; 2475 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie MALT1
1Niski
Jak trudno sekwencjonować MALT1 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych MALT1 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.2,9%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.6,8%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
22
pozycje w MALT1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 83 kb MALT1, łącznie z intronami, a nie tylko 9,3 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ADAadenosine deaminaseWspólne schorzenie: 1
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseWspólne schorzenie: 1
- AK2adenylate kinase 2Wspólne schorzenie: 1
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BWspólne schorzenie: 1
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Wspólne schorzenie: 1
- ATMATM serine/threonine kinaseWspólne schorzenie: 1
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Wspólne schorzenie: 1
- B2Mbeta-2-microglobulinWspólne schorzenie: 1
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Wspólne schorzenie: 1
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorWspólne schorzenie: 1
- BCL11BBCL11 transcription factor BWspólne schorzenie: 1
- BLNKB cell linkerWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem MALT1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać MALT1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.18-e609d43e.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen MALT1: MALT1 paracaspase. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/malt1
Dante Labs. Gen MALT1: MALT1 paracaspase [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/malt1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni