Gen
AGRN
agrin
- HGNC 329↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000188157↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 375790↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1p36.33
- Koordinater
- Kromosom 1: 1 020 120–1 056 116 (GRCh38)
- Eksoner
- 36 eksoner over 36 kb
- Protein
- 2 045 aminosyrer
- Tidligere symboler
- AGRIN
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000379370.7NM_198576.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/agrn.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes AGRN og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Kongenitt myasthent syndrom
- Kongenitt myasthent syndrom 8Autosomal recessiv
Ethvert kongenitt myasthent syndrom der sykdommen skyldes en mutasjon i AGRN-genet.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Medfødt myasteniskt syndrom (alle typer)
Samlebegrep som dekker alle medfødte myasteniske syndromer, inkludert de vanlige formene med CHRNE, RAPSN, DOK7 og MUSK.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Mange former reagerer på spesifikke legemidler, som pyridostigmin, salbutamol eller efedrin, og riktig valg avhenger av hvilket gen som er involvert.
Slik er AGRN bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 7,3 kb av genets 36 kb, og 6 138 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av AGRN
55
posisjoner i AGRN der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 36 kb av AGRN, inkludert introner, ikke bare de 7,3 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 tilstand
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeler 1 tilstand
- CHATcholine O-acetyltransferaseDeler 1 tilstand
- CHRNA1cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunitDeler 1 tilstand
- CHRNB1cholinergic receptor nicotinic beta 1 subunitDeler 1 tilstand
- CHRNDcholinergic receptor nicotinic delta subunitDeler 1 tilstand
- CHRNEcholinergic receptor nicotinic epsilon subunitDeler 1 tilstand
- COL13A1collagen type XIII alpha 1 chainDeler 1 tilstand
- COLQcollagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesteraseDeler 1 tilstand
- DOK7docking protein 7Deler 1 tilstand
- DPAGT1dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1Deler 1 tilstand
- GFPT1glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til AGRN
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene AGRN kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). AGRN-genet: agrin. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/agrn
Dante Labs. AGRN-genet: agrin [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/agrn
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker