Gene
SSR4
signal sequence receptor subunit 4
- HGNC 11326↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000180879↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 6748↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- Xq28
- Coordinate
- Cromosoma X: 153.794.668–153.798.499 (GRCh38)
- Esoni
- 6 esoni su 3,8 kb
- Proteina
- 173 amminoacidi
- Noto anche come
- TRAPD
- Trascritto MANE Select
- ENST00000370086.8NM_006280.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Glicosilazione congenita disturbata (CDG)
Uno di 98 geni collegati ad esso
Un ampio gruppo di condizioni ereditarie in cui le catene di zuccheri (glicani) non vengono costruite o attaccate correttamente a proteine e lipidi, con effetti spesso su cervello, fegato, coagulazione del sangue, crescita e molti altri sistemi dell'organismo. La maggior parte è autosomica recessiva, ma alcune sono legate al cromosoma X o autosomiche dominanti.
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di SSR4
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 0,6 kb dei 3,8 kb del gene; 522 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SSR4
7
posizioni in SSR4 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 3,8 kb di SSR4, introni inclusi, non solo i 0,6 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Condivide 1 condizione
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitCondivide 1 condizione
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitCondivide 1 condizione
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Condivide 1 condizione
Tratti collegati a SSR4
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SSR4 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SSR4: signal sequence receptor subunit 4. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ssr4
Dante Labs. Gene SSR4: signal sequence receptor subunit 4 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ssr4
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