Gene
SLC12A6
solute carrier family 12 member 6
- HGNC 10914↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000140199↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 9990↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 15q14
- Coordinate
- Cromosoma 15: 34.229.784–34.337.781 (GRCh38)
- Esoni
- 26 esoni su 108 kb
- Proteina
- 1150 amminoacidi
- Noto anche come
- KCC3A, KCC3B
- Simboli precedenti
- KCC3, ACCPN
- Trascritto MANE Select
- ENST00000354181.8NM_001365088.1
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.
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Malattia di Charcot-Marie-Tooth
Uno di 62 geni collegati ad esso
Un gruppo di neuropatie periferiche ereditarie che provocano debolezza e atrofia progressiva dei muscoli distali e perdita della sensibilità, principalmente a livello di piedi e mani.
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Consulenza genetica, monitoraggio specifico per sottotipo, fisioterapia, ortesi, prevenzione dell'uso di farmaci neurotossici, studi clinici gene-specifici, sorveglianza delle manifestazioni associate
Struttura di SLC12A6
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 8,1 kb dei 108 kb del gene; 3453 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SLC12A6
159
posizioni in SLC12A6 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 108 kb di SLC12A6, introni inclusi, non solo i 8,1 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Condivide 1 condizione
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Condivide 1 condizione
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Condivide 1 condizione
- CADM3cell adhesion molecule 3Condivide 1 condizione
- COX6A1cytochrome c oxidase subunit 6A1Condivide 1 condizione
- DHTKD1dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1Condivide 1 condizione
- DHX9DExH-box helicase 9Condivide 1 condizione
- DNM2dynamin 2Condivide 1 condizione
- DRP2dystrophin related protein 2Condivide 1 condizione
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Condivide 1 condizione
- EGR2early growth response 2Condivide 1 condizione
- FBLN5fibulin 5Condivide 1 condizione
Tratti collegati a SLC12A6
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SLC12A6 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Absent reflexes
- Agenesis of corpus callosum
- Axonal loss
- Decreased motor nerve conduction velocity
- Decreased nerve conduction velocity
- Global developmental delay
- Motor axonal neuropathy
- Motor delay
Mostra altri 24 tratti
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Interictal epileptiform activity
- Paralysis or weakness of one side of body
- Abolished vibration sense
- Absent speech development
- Aqueductal stenosis
- Diffuse white matter abnormalities
- Inability to walk
- Intellectual disability, mild
- Peripheral neuropathy
- Ventriculomegaly
- Axonal degeneration/regeneration
- Damage to nerves that sense feeling
- Decreased sensory nerve conduction velocity
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Limb tremor
- Motor polyneuropathy
- Onion bulb formation
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral nerve disease
- Psychosis
- Tremor
Abnormality of limbs
- Distal lower limb muscle weakness
- Foot drop
- Intrinsic hand muscle atrophy
- Lower limb muscle weakness
- Distal upper limb amyotrophy
- Proximal upper limb muscle weakness
- Shortening of the achilles tendon
- Limb muscle weakness
Mostra altri 3 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SLC12A6: solute carrier family 12 member 6. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slc12a6
Dante Labs. Gene SLC12A6: solute carrier family 12 member 6 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slc12a6
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