Gén
DNAL1
dynein axonemal light chain 1
- HGNC 23247↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000119661↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 83544↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 14q24.3
- Koordináták
- 14. kromoszóma: 73 644 986–73 703 732 (GRCh38)
- Exonok
- 8 exon, összesen 58,7 kb
- Fehérje
- 190 aminosav
- Más néven ismert
- MGC12435, 1700010H15RiK, CILD16
- Korábbi jelölések
- C14orf168
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000553645.7NM_031427.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dnal1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a DNAL1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Primary Ciliary Dyskinesia
- Autoszomális recesszív
A rare, genetically heterogeneous, primarily respiratory disorder characterized by chronic upper and lower respiratory tract disease. Approximately half of PCD patients have an organ laterality defect (situs inversus totalis or situs ambiguus/heterotaxy).
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A DNAL1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 58,7 kb-jából 8,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 573 bázis kódolja a fehérjét.
DNAL1 szekvenálása
2Alacsony
Mennyire nehéz a DNAL1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy DNAL1 exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.3,2%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.5,3%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.5,1%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
11
a DNAL1 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a DNAL1 gén mind a 58,7 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 8,4 kb-nyi exont.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- CCDC39coiled-coil domain 39 molecular ruler complex subunit1 betegséget oszt meg
- CCDC40coiled-coil domain 40 molecular ruler complex subunit1 betegséget oszt meg
- CCNOcyclin O1 betegséget oszt meg
- CENPFcentromere protein F1 betegséget oszt meg
- CFAP20DCCFAP20 domain containing1 betegséget oszt meg
- CFAP221cilia and flagella associated protein 2211 betegséget oszt meg
- CFAP298cilia and flagella associated protein 2981 betegséget oszt meg
- CFAP300cilia and flagella associated protein 3001 betegséget oszt meg
- CFAP54cilia and flagella associated protein 541 betegséget oszt meg
- CLXNcalaxin1 betegséget oszt meg
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 11 betegséget oszt meg
- DNAAF1dynein axonemal assembly factor 11 betegséget oszt meg
A(z) DNAL1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) DNAL1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). DNAL1 gén: dynein axonemal light chain 1. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/dnal1
Dante Labs. DNAL1 gén: dynein axonemal light chain 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/dnal1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt