Replicate whole-genome next-generation sequencing data derived from Caucasian donor saliva samples

Dante Labs a réalisé l’extraction de l’ADN, le contrôle qualité, la préparation des banques et le séquençage dans le cadre de cette étude, en tant que prestataire de séquençage pour les trois réplicats. L’équipe de recherche a recueilli la salive d’un seul donneur anonyme à l’aide de kits de prélèvement d’ADN salivaire GeneFiX, puis les échantillons ont été traités par lots distincts dans notre laboratoire de L’Aquila, en Italie, sur une période d’environ un an. Le séquençage a été effectué sur notre plateforme Illumina NovaSeq 6000, produisant des lectures appariées en trois réplicats — 1,38 milliard au total — avec des profondeurs moyennes ciblées de 30x pour deux des échantillons et de 4x pour l’échantillon à faible couverture. Les données ont été remises à l’équipe de recherche sous forme de fichiers FASTQ bruts compressés au format gzip.

Les auteurs remercient également Dante Labs dans les remerciements pour son aide prolongée dans la récupération des données. L’évaluation bio-informatique décrite dans l’article (alignement, détection des variants et évaluation de la qualité) a été réalisée par l’équipe de recherche.