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Gène

POPDC2

popeye domain cAMP effector 2

Résumé

Localisation cytogénétique
3q13.33
Coordonnées
Chromosome 3 : 119 642 056–119 660 589 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 18,5 kb
Protéine
368 acides aminés
Aussi appelé
POP2
Transcrit MANE Select
ENST00000493094.6NM_001369919.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Structure de POPDC2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de POPDC2. POPDC2 et 16 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 119 151 323 à 120 151 322.Chromosome 33q13.33p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29119,2 Mb119,4 Mb119,6 Mb119,8 Mb120 MbTEX55 : 119 146 151–119 160 042, brin directTEX55 : 119 147 375–119 187 807, brin directUPK1B : 119 173 516–119 205 758, brin directUPK1BB4GALT4 : 119 208 851–119 240 952, brin inverseB4GALT4ARHGAP31 : 119 294 031–119 420 824, brin directARHGAP31TMEM39A : 119 428 949–119 468 854, brin inverseTMEM39APOGLUT1 : 119 468 791–119 494 708, brin directPOGLUT1TIMMDC1 : 119 498 515–119 525 090, brin directTIMMDC1CD80 : 119 523 073–119 580 616, brin inverseCD80ADPRH : 119 579 268–119 590 165, brin directADPRHPLA1A : 119 597 808–119 629 818, brin directPLA1APOPDC2 : 119 642 056–119 660 589, brin inversePOPDC2COX17 : 119 654 513–119 677 621, brin inverseCOX17CFAP91 : 119 702 990–119 767 102, brin directCFAP91 : 119 703 076–119 807 570, brin directNR1I2 : 119 780 484–119 818 718, brin directNR1I2GSK3B : 119 821 321–120 095 712, brin inverseGSK3BSchéma de POPDC2 : 4 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 4 : 119 642 056–119 642 561, 506 basesExon 3 : 119 648 119–119 648 668, 550 basesExon 2 : 119 654 505–119 654 613, 109 basesExon 1 : 119 659 933–119 660 589, 657 bases43215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,8 kb sur les 18,5 kb du gène ; 1 107 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène POPDC2 : popeye domain cAMP effector 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/popdc2

Vancouver

Dante Labs. Gène POPDC2 : popeye domain cAMP effector 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/popdc2

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