Gène
PLOD2
procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2
- HGNC 9082(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000152952(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 5352(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 3q24
- Coordonnées
- Chromosome 3 : 146 069 440–146 161 184 (GRCh38)
- Exons
- 20 exons sur 91,7 kb
- Protéine
- 758 acides aminés
- Aussi appelé
- LH2, TLH
- Transcrit MANE Select
- ENST00000282903.10NM_182943.3
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Ostéogenèse imparfaite
Un groupe de maladies héréditaires du tissu conjonctif entraînant une fragilité osseuse avec des fractures fréquentes, souvent associées à des sclérotiques bleues, une perte auditive et des anomalies dentaires.
- 3 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Bisphosphonates intraveineux cycliques (pamidronate, zoledronate) ; enclouage orthopédique centro-médullaire des os longs ; kinésithérapie ; denosumab (utilisé en pratique clinique dans l'OI pédiatrique) ; romosozumab (en cours de développement) ; surveillance de l'audition ; prise en charge dentaire pour la dentinogenèse imparfaite
Structure de PLOD2
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 3,7 kb sur les 91,7 kb du gène ; 2 277 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit PLOD2
23
positions dans PLOD2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 91,7 kb de PLOD2, introns compris, et pas seulement les 3,7 kb d'exons.
Traits associés à PLOD2
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que PLOD2 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène PLOD2 : procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/plod2
Dante Labs. Gène PLOD2 : procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/plod2
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