Geeni
NDUFS1
NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1
- HGNC 7707↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000023228↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 4719↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2q33.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 206 114 817–206 159 444 (GRCh38)
- Eksonit
- 19 eksonia 44,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 727 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CI-75k
- MANE Select -transkripti
- ENST00000233190.11NM_005006.7
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ndufs1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue NDUFS1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Leighin oireyhtymä
Yksi 69 siihen liittyvästä geenistä
Etenevä neurologinen sairaus, jolle ovat tunnusomaisia tietyt neuropatologiset piirteet, joissa aivorungon ja tyvitumakkeiden vauriot esiintyvät yhdessä.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
Primaarinen mitokondriosairaus
- Mitokondrion hengitysketjun kompleksin puutos
Yksi 61 siihen liittyvästä geenistä
Kompleksien I, II, III, IV tai V yksittäinen puutos, jota aiheuttavat tumagenomin tai mitokondrion geenien variantit. Se voi vaikuttaa aivoihin, lihaksiin, sydämeen, maksaan ja muihin energiaa vaativiin elimiin.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tieto voi lopettaa diagnoosin etsimisen ja ohjata sairastuneiden elinten seurantaa sekä mitokondrioille myrkyllisten lääkkeiden välttämistä.
NDUFS1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 11,7 kb geenin 44,6 kb:stä; 2 184 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: NDUFS1
5Matala
Kuinka vaikea NDUFS1 on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100Jokainen palkki kuvaa sen osuutta NDUFS1-geenin eksonien emäksistä kyseisessä vaikeassa alueessa. Pisteet painottavat alueita sen mukaan, kuinka paljon kukin vaikeuttaa lyhyiden lukemien variantinkutsua: 0, kun mikään emäs ei kuulu mihinkään vaikeaan alueeseen, ja 100, kun jokainen emäs kuuluu kaikkiin niistä.
- KartoitettavuusAlueet, joilla 100 tai 250 emäsparin lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten kutsu siellä voi puuttua tai olla virheellinen. Paino 35 %.2 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatit: kopiot muualla genomissa, kuten paraloogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identtisyydellä. Paino 30 %.8,7 %
- ToistotTandeemitoistot ja saman emäksen toistuvat jaksot, joilla lukemat luistavat ja joita ne eivät välttämättä kata. Paino 15 %.6,6 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emästen osuus on alle 25 % tai yli 65 %, ja joita kirjastonvalmistus kattaa ohuesti. Paino 10 %.3,1 %
- Referenssin peittävyysLähellä olevan referenssikokoonpanon aukot, joissa ei ole sekvenssiä, johon lukemat voisivat kohdistua. Paino 10 %.0 %
29
kohtaa NDUFS1-geenissä, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Yksikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 44,6 kb NDUFS1-geenistä, intronit mukaan lukien, eikä vain 11,7 kb eksoneista.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Yhteisiä sairauksia: 2
- FOXRED1FAD dependent oxidoreductase domain containing 1Yhteisiä sairauksia: 2
- LRPPRCleucine rich pentatricopeptide repeat containingYhteisiä sairauksia: 2
- NDUFA1NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFA13NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFA2NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A2Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFA9NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFAF2NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFAF5NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFAF6NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFAF8NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 8Yhteisiä sairauksia: 2
- NDUFB8NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B8Yhteisiä sairauksia: 2
Geeniin NDUFS1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NDUFS1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Cross-eyed
- Damaged optic nerve
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc pallor
- Paroxysmal involuntary eye movements
- Eye muscle paralysis
- Optic atrophy
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NDUFS1-geeni: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ndufs1
Dante Labs. NDUFS1-geeni: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ndufs1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa