Geen
WNT2B
Wnt family member 2B
- HGNC 12781↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000134245↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 7482↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1p13.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 112 508 965–112 530 165 (GRCh38)
- Eksonid
- 5 eksonit, ulatus 21,2 kb
- Valk
- 391 aminohapet
- Tuntud ka kui
- XWNT2
- Varasemad tähised
- WNT13
- MANE Select transkript
- ENST00000369684.5NM_024494.3
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/wnt2b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe WNT2B ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Kongenitaalsed diarrhoad ja enteropaatiad
- Kongenitaalne diarrhoea
Pärilikud haigused, sealhulgas kongenitaalne kloriiddiarrhoea (SLC26A3), mikrovillusinklusioonhaigus (MYO5B), tufting-enteropaatia (EPCAM) ja kongenitaalne naatriumdiarrhoea (SPINT2, SLC9A3), mis põhjustavad krooniliselt kõhulahtisust juba varajases imikueas.
- 2 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Täpne diagnoos suunab ravi, näiteks elektrolüütide asendusravi kloriiddiarrhoea korral või varajast parenteraalse toitmise või soolesiirdamise planeerimist mikrovillusinklusioonhaiguse ja tufting-enteropaatia korral.
Kuidas WNT2B on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 11,1 kb kogupikkusega 21,2 kb; neist 1176 alust kodeerivad valku.
WNT2B sekventeerimine
1Madal
Kui raske on WNT2B lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100Iga riba näitab, kui suur osa WNT2B eksoni aluspaaridest asub sellist liiki keerulises piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemiste analüüsi raskendab: 0, kui ükski alus ei asu üheski piirkonnas, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tehtud määrang puududa või olla vale. Kaal 35%.1,1%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, nagu paralogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.4%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-osakaal on alla 25% või üle 65%; raamatukogu ettevalmistus katab neid nõrgalt. Kaal 10%.4,3%
- ViitekatvusLüngad lähedal asuvas viitekoostises, kuhu lugemised ei saa joonduda, sest järjestust seal ei ole. Kaal 10%.0%
3
positsioonid geenis WNT2B, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Ükski neist ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti leiavad.
Kogu genoomi sekventeerimine katab kogu WNT2B 21,2 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 11,1 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- DGAT1diacylglycerol O-acyltransferase 1Jagab 1 haigust
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeJagab 1 haigust
- GUCY2Cguanylate cyclase 2CJagab 1 haigust
- MYO5Bmyosin VBJagab 1 haigust
- NEUROG3neurogenin 3Jagab 1 haigust
- PLVAPplasmalemma vesicle associated proteinJagab 1 haigust
- SLC26A3solute carrier family 26 member 3Jagab 1 haigust
- SLC5A1solute carrier family 5 member 1Jagab 1 haigust
- SLC9A3solute carrier family 9 member A3Jagab 1 haigust
- SPINT2serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2Jagab 1 haigust
- STX3syntaxin 3Jagab 1 haigust
Geeniga WNT2B seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida WNT2B võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-17: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). WNT2B geen: Wnt family member 2B. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/wnt2b
Dante Labs. WNT2B geen: Wnt family member 2B [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/wnt2b
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast