Gen
GCSH
glycine cleavage system protein H
- HGNC 4208↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000140905↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 2653↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 16q23.2
- Koordinater
- Kromosom 16: 81.081.945–81.096.395 (GRCh38)
- Exoner
- 5 exoner fordelt over 14,5 kb
- Protein
- 173 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal recessiv
- MANE Select-transkript
- ENST00000315467.9NM_004483.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs GCSH og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Arvelige sygdomme i glycin- og serinstofskiftet
- Glycinencephalopati (ikke-ketotisk hyperglycinæmi)Autosomal recessiv
Forårsaget af varianter i GLDC, AMT eller GCSH (og i en atypisk form SLC6A9), som giver højt glycinindhold i hjernen og kan føre til krampeanfald, lav muskelspænding og udviklingsforsinkelse.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden gør det muligt at behandle med natriumbenzoat og dextromethorphan, som kan reducere krampeanfald ved nogle former.
Arvegang
- Autosomal recessiv
- Det kræver en ændret kopi fra hver forælder. Med én er man bærer og som regel upåvirket; når begge forældre er bærere, har hvert barn en chance på en ud af fire for at arve to.
Sådan er GCSH opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1,6 kb af genets 14,5 kb; 522 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest GCSH
8
positioner i GCSH, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
1 af dem (13 %) ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
- Low mappability (1 sted)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalyse dækker alle 14,5 kb af GCSH, inklusive introner, og ikke kun de 1,6 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
Træk knyttet til GCSH
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, GCSH kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal diffusion weighted cerebral MRI morphology
- Absent reflexes
- Agitation
- Autism spectrum disorder
- Coma
- Dystonia
- EEG with burst suppression
- Elevated brain glycine level by MRS
Vis 19 træk mere
- Elevated brain lactate level by MRS
- Epilepsy
- Exaggerated startle response
- Global developmental delay
- Hallucinations
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Increased reflexes
- Infantile spasms
- Irritability
- Jerking
- Lethargy
- More active than typical
- Multifocal seizures
- Myoclonic seizure
- Reduced brain N-acetyl aspartate level by MRS
- Seizure affecting one half of brain
- Thin corpus callosum
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). GCSH-genet: glycine cleavage system protein H. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/gcsh
Dante Labs. GCSH-genet: glycine cleavage system protein H [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/gcsh
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger