Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

NKX3-2

NK3 homeobox 2

Shrnutí

Cytogenetická poloha
4p15.33
Souřadnice
Chromozom 4: 13 540 830–13 544 508 (GRCh38)
Exony
2 exonů na 3,7 kb
Protein
333 aminokyselin
Další názvy
NKX3B, NKX3.2
Předchozí symboly
BAPX1
Transkript MANE Select
ENST00000382438.6NM_001189.4
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen NKX3-2. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je NKX3-2 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
Chromozom 4, se závorkou u NKX3-2. NKX3-2 a 2 genů poblíž na chromozomu 4, od 13 042 669 do 14 042 668.Chromozom 44p15.33p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.213,2 Mb13,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 MbRAB28: 13 245 110–13 484 365, řetězec zpětnémRAB28NKX3-2: 13 540 830–13 544 508, řetězec zpětnémNKX3-2BOD1L1: 13 568 738–13 627 741, řetězec zpětnémBOD1L1Schéma NKX3-2: 2 exonů na zpětném řetězci chromozomu 4Exon 1: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 2: 13 540 830–13 542 528, 1 699 bázíExon 1: 13 543 949–13 544 508, 560 bází215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,3 kb z 3,7 kb genu; 1 002 těchto bází kódují protein.

Sekvenování NKX3-2

8Nízká

Jak obtížně se NKX3-2 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

  • Mapovatelnost0 %
  • Homologie0 %
  • Repetice7,2 %
  • Obsah GC68 %
  • Pokrytí reference0 %

1

pozice v NKX3-2, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Žádná z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.

Celé genomové sekvenování pokrývá všech 3,7 kb genu NKX3-2, včetně intronů, nejen 2,3 kb exonů.

Rysy spojené s NKX3-2

Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit NKX3-2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen NKX3-2: NK3 homeobox 2. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/nkx3-2

Vancouver

Dante Labs. Gen NKX3-2: NK3 homeobox 2 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/nkx3-2

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test