Gen
ATP9A
ATPase phospholipid transporting 9A
- HGNC 13540↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000054793↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 10079↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 20q13.2
- Souřadnice
- Chromozom 20: 51 596 514–51 768 390 (GRCh38)
- Exony
- 28 exonů na 171,9 kb
- Protein
- 1 047 aminokyselin
- Další názvy
- KIAA0611, ATPIIA
- Transkript MANE Select
- ENST00000338821.6NM_006045.3
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp9a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si ATP9A i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen ATP9A. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.
Jak je ATP9A uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 7,9 kb z 171,9 kb genu; 3 144 těchto bází kódují protein.
Sekvenování ATP9A
4
pozic v ATP9A, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení obtížně zpracovávají.
Celý genom pokrývá všech 171,9 kb genu ATP9A včetně intronů, nejen 7,9 kb exonů.
ClinVar pathogenic variants (4)
The ATP9A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenní 1
- Pravděpodobně patogenní 3
| Varianta | Conditions | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|
| NM_006045.3(ATP9A):c.2701G>T (p.Glu901Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with poor growth and behavioral abnormalities | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_006045.3(ATP9A):c.2031_2032del (p.Asp679fs) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with poor growth and behavioral abnormalities | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_006045.3(ATP9A):c.1777C>T (p.Arg593Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with poor growth and behavioral abnormalities | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_006045.3(ATP9A):c.1181-2A>G (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with poor growth and behavioral abnormalities | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
Rysy spojené s ATP9A
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit ATP9A. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Delayed speech and language development
- Incoordination
- Motor delay
- Poor fine motor coordination
- Receptive language delay
Zobrazit ještě 13 rysů
- Repetitive movements
- Short attention span
- Difficulty sleeping
- Autism spectrum disorder
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Delayed CNS myelination
- Depression
- Emotional discomfort
- Epilepsy
- Intellectual disability, mild
- Intellectual disability, severe
- More active than typical
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.18-8b139e39.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ATP9A: ATPase phospholipid transporting 9A. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/atp9a
Dante Labs. Gen ATP9A: ATPase phospholipid transporting 9A [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/atp9a
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů