Gen
NFS1
NFS1 cysteine desulfurase
- HGNC 15910↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000244005↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 9054↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 20q11.22
- Koordinater
- Kromosom 20: 35 668 052–35 699 352 (GRCh38)
- Exoner
- 13 exoner på 31,3 kb
- Protein
- 457 aminosyror
- Även känd som
- NifS, IscS
- MANE Select-transkript
- ENST00000374092.9NM_021100.5
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nfs1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs NFS1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Primär mitokondriell sjukdom
- Kombinerad brist på oxidativ fosforylering
Sjukdomar, oftast orsakade av kärngener som deltar i produktionen av mitokondrieproteiner. De minskar flera andningskedjekomplex samtidigt och ger ofta allvarlig sjukdom i flera organsystem under barndomen.
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Kunskapen kan avsluta en diagnostisk sökning och vägleda uppföljning och stödjande vård.
Så är NFS1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3 kb av genens 31,3 kb, och 1 374 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av NFS1
2Lätt
Hur svår NFS1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i NFS1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av NFS1:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 100 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vikt 60 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 50 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 30 %.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 20 %.11 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av NFS1:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDelar 1 tillstånd
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Delar 1 tillstånd
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaDelar 1 tillstånd
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaDelar 1 tillstånd
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonDelar 1 tillstånd
- ATP5POATP synthase peripheral stalk subunit OSCPDelar 1 tillstånd
- C1QBPcomplement C1q binding proteinDelar 1 tillstånd
- C2orf69chromosome 2 open reading frame 69Delar 1 tillstånd
- CARS2cysteinyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDelar 1 tillstånd
- CRLS1cardiolipin synthase 1Delar 1 tillstånd
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDelar 1 tillstånd
- ELAC2elaC ribonuclease Z 2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till NFS1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som NFS1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Laboratory abnormality
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Elevated blood glycine levels
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Fatty infiltration of liver
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Metabolic acidosis
Visa ytterligare 4 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-19: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.19-9814e911.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). NFS1-genen: NFS1 cysteine desulfurase. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nfs1
Dante Labs. NFS1-genen: NFS1 cysteine desulfurase [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nfs1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor