Gen
IL21R
interleukin 21 receptor
- HGNC 6006↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000103522↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 50615↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 16p12.1
- Koordinater
- Kromosom 16: 27 402 174–27 452 042 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner på 49,9 kb
- Protein
- 538 aminosyror
- Även känd som
- CD360
- MANE Select-transkript
- ENST00000337929.8NM_181078.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/il21r.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs IL21R, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Så är IL21R uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,8 kb av genens 49,9 kb, och 1 617 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av IL21R
6Lätt
Hur svår IL21R är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i IL21R ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som tillkommer: andelen av IL21Rs exoner i varje typ av svår region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 100.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- Delas med chrYDe pseudoautosomala regionerna och den X-transponerade regionen, där chrX och chrY bär samma eller nästan samma sekvens, så en läsning från den ena kan placeras på den andra. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassemblyn, där det inte finns någon sekvens för läsningarna att anpassas mot. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 50.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, där läsningar glider och som kanske inte spänns över. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 30.5 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker glest. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 20.20 %
Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av IL21Rs exonbaser i den typen av svår region. Varje enskild typ kan göra en gen svår på egen hand, och varje ytterligare typ lägger till mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
9
positioner i IL21R där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsprov täcker alla 49,9 kb av IL21R, inklusive introner, och inte bara de 4,8 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (9)
The IL21R variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 4
- Sannolikt patogen 5
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_181078.3(IL21R):c.27dup (p.Leu10fs) (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.468T>A (p.Tyr156Ter) (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.503_507+3del (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.842dup (p.Tyr281Ter) (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.352+1G>C (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.507+1G>A (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.637del (p.Thr213fs) (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.686-2A>G (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_181078.3(IL21R):c.946del (p.Val316fs) (opens in a new tab) | cryptosporidiosis-chronic cholangitis-liver disease syndrome | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ADAadenosine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AK2adenylate kinase 2Delar 1 tillstånd
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BDelar 1 tillstånd
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Delar 1 tillstånd
- ATMATM serine/threonine kinaseDelar 1 tillstånd
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Delar 1 tillstånd
- B2Mbeta-2-microglobulinDelar 1 tillstånd
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Delar 1 tillstånd
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDelar 1 tillstånd
- BCL11BBCL11 transcription factor BDelar 1 tillstånd
- BLNKB cell linkerDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till IL21R
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som IL21R kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-19: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.19-9814e911.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). IL21R-genen: interleukin 21 receptor. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/il21r
Dante Labs. IL21R-genen: interleukin 21 receptor [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/il21r
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor