Gen
GPR179
G protein-coupled receptor 179
- HGNC 31371↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000277399↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 440435↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 17q12
- Koordinater
- Kromosom 17: 38 324 571–38 343 956 (GRCh38)
- Exoner
- 11 exoner på 19,4 kb
- Protein
- 2 367 aminosyror
- Även känd som
- CSNB1E
- Tidigare symboler
- GPR158L1
- MANE Select-transkript
- ENST00000616987.5NM_001004334.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gpr179.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs GPR179, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Medfödd stationär nattblindhet
En grupp näthinnesjukdomar som till största delen inte fortskrider, bland annat Oguchis sjukdom, orsakade av förändringar i gener som NYX, CACNA1F, TRPM1, GRM6, GPR179 och SAG, ofta med nystagmus eller närsynthet.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
En genetisk diagnos förklarar symtomen, hjälper till att skilja tillståndet från progressiva näthinnesjukdomar och ger underlag för familjerådgivning.
Så är GPR179 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 9,2 kb av genens 19,4 kb, och 7 104 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av GPR179
18
positioner i GPR179 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsekvensering täcker alla 19,4 kb av GPR179, inklusive introner, inte bara de 9,2 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (18)
The GPR179 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 4
- Sannolikt patogen 14
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_001004334.4(GPR179):c.984del (p.Ser329fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_001004334.4(GPR179):c.4550dup (p.Met1517fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_001004334.4(GPR179):c.1667G>A (p.Trp556Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.1368del (p.Phe456fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.598C>T (p.Arg200Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.3934_3935del (p.Arg1312fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.3553C>T (p.Gln1185Ter) (opens in a new tab) | retinal disorder | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.3238C>T (p.Gln1080Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.3049C>T (p.Arg1017Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.2706_2707dup (p.Pro903fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.2398C>T (p.Arg800Ter) (opens in a new tab) | retinal disorder | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.1727del (p.Tyr576fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.958C>T (p.Arg320Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E and 1 other | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.951C>A (p.Cys317Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NC_000017.11:g.38339517_38339521delinsGTAGATCA (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.659A>G (p.Tyr220Cys) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.481C>T (p.Gln161Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001004334.4(GPR179):c.148C>T (p.Gln50Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1E | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Gener kopplade till samma tillstånd
- CABP4calcium binding protein 4Delar 1 tillstånd
- CACNA1Fcalcium voltage-gated channel subunit alpha1 FDelar 1 tillstånd
- GNAT1G protein subunit alpha transducin 1Delar 1 tillstånd
- GNB3G protein subunit beta 3Delar 1 tillstånd
- GRK1G protein-coupled receptor kinase 1Delar 1 tillstånd
- GRM6glutamate metabotropic receptor 6Delar 1 tillstånd
- GUCY2Dguanylate cyclase 2D, retinalDelar 1 tillstånd
- LRIT3leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 3Delar 1 tillstånd
- NYXnyctalopinDelar 1 tillstånd
- PDE6Bphosphodiesterase 6BDelar 1 tillstånd
- RHOrhodopsinDelar 1 tillstånd
- RIMS2regulating synaptic membrane exocytosis 2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till GPR179
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som GPR179 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-18: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.18-8b139e39.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). GPR179-genen: G protein-coupled receptor 179. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gpr179
Dante Labs. GPR179-genen: G protein-coupled receptor 179 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gpr179
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor