Gene
VSX2
visual system homeobox 2
- HGNC 1975↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000119614↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 338917↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 14q24.3
- Coordenadas
- Cromossoma 14: 74 239 449–74 262 738 (GRCh38)
- Exões
- 5 exões ao longo de 23,3 kb
- Proteína
- 361 aminoácidos
- Também conhecido como
- RET1
- Símbolos anteriores
- HOX10, CHX10
- Transcrito MANE Select
- ENST00000261980.3NM_182894.3
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Microftalmia, Anoftalmia e Coloboma
- Anoftalmia, Microftalmia e Coloboma Isoladas
Malformações oculares sem outras características, incluindo nanoftalmia, causadas por alterações em genes como VSX2, RAX, MFRP, PRSS56 e outros.
- 4 submissores GenCC classificam-na como definitiva ou forte
O que a informação altera
As pessoas com nanoftalmia (frequentemente MFRP ou PRSS56) têm um risco aumentado de glaucoma de ângulo fechado e necessitam de consultas oftalmológicas regulares; um diagnóstico genético também informa o risco de recorrência.
Como VSX2 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 3 kb dos 23,3 kb do gene; 1086 dessas bases codificam a proteína.
Como um teste de genoma lê VSX2
60
posições em VSX2 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.
Um genoma completo abrange todos os 23,3 kb de VSX2, incluindo os intrões, e não apenas os 3 kb de exões.
Genes associados às mesmas condições
- ALDH1A3aldehyde dehydrogenase 1 family member A3Partilha 1 condição
- FZD5frizzled class receptor 5Partilha 1 condição
- MFRPmembrane frizzled-related proteinPartilha 1 condição
- PRSS56serine protease 56Partilha 1 condição
- RAXretina and anterior neural fold homeoboxPartilha 1 condição
- RBP4retinol binding protein 4Partilha 1 condição
- SHHsonic hedgehog signaling moleculePartilha 1 condição
- TMEM98transmembrane protein 98Partilha 1 condição
Características associadas a VSX2
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que VSX2 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem esta informação
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicado em 2026-10-16: as condições a que o gene está associado e o grau dessa associação.
- A lista ACMG de achados secundários, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene VSX2: visual system homeobox 2. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/vsx2
Dante Labs. Gene VSX2: visual system homeobox 2 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/vsx2
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