Gen
ATXN7
ataxin 7
- HGNC 10560↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000163635↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6314↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 3p14.1
- Współrzędne
- Chromosom 3: 63 863 867–64 003 462 (GRCh38)
- Eksony
- 13 eksonów na odcinku 139,6 kb
- Białko
- 892 aminokwasów
- Znany również jako
- OPCA3, ADCAII, SGF73
- Poprzednie symbole
- SCA7
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000674280.1NM_001377405.1
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atxn7.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj ATXN7 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Autosomalnie dominujące ataksje móżdżkowe (SCA i DRPLA)
- Autosomalnie dominująca ataksja móżdżkowaAutosomalne dominujące
Grupa dominująco dziedziczonych ataksji, w tym SCA1, SCA2, SCA3 (choroba Machado-Josepha), SCA6, SCA7, SCA17, SCA27B oraz DRPLA, wywoływanych przez ekspansje powtórzeń lub warianty punktowe w genach takich jak ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, ATXN7, TBP, ATN1 i FGF14.
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Poradnictwo genetyczne i badania presymptomatyczne dla krewnych, fizjoterapia oraz leczenie objawów; niektóre postacie, takie jak SCA27B, mogą reagować na określone leki.
Budowa genu ATXN7
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 7,1 kb z 139,6 kb genu; 2679 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie ATXN7
3Niski
Jak trudno sekwencjonować ATXN7 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych ATXN7 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.7%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.15%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
1
pozycja w ATXN7, w której ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 139,6 kb ATXN7, łącznie z intronami, a nie tylko 7,1 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Wspólne schorzenie: 1
- ATN1atrophin 1Wspólne schorzenie: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Wspólne schorzenie: 1
- ATXN1ataxin 1Wspólne schorzenie: 1
- ATXN10ataxin 10Wspólne schorzenie: 1
- ATXN2ataxin 2Wspólne schorzenie: 1
- ATXN3ataxin 3Wspólne schorzenie: 1
- BEAN1brain expressed associated with NEDD4 1Wspólne schorzenie: 1
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 AWspólne schorzenie: 1
- CACNA1Gcalcium voltage-gated channel subunit alpha1 GWspólne schorzenie: 1
- CAMTA1calmodulin binding transcription activator 1Wspólne schorzenie: 1
- DAB1DAB adaptor protein 1Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem ATXN7
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać ATXN7. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen ATXN7: ataxin 7. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/atxn7
Dante Labs. Gen ATXN7: ataxin 7 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/atxn7
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni