Gen
PIKFYVE
phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing
- HGNC 23785↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000115020↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 200576↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 2q34
- Koordinater
- Kromosom 2: 208 266 255–208 358 746 (GRCh38)
- Eksoner
- 42 eksoner over 92,5 kb
- Protein
- 2 098 aminosyrer
- Også kjent som
- MGC40423, KIAA0981, PIP5K, p235, ZFYVE29, FAB1
- Tidligere symboler
- PIP5K3
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000264380.9NM_015040.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pikfyve.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes PIKFYVE og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Arvelige hornhinnedystrofier
- Hornhinnedystrofi
En gruppe arvelige tilstander som rammer ett eller flere lag av hornhinnen, blant annet Fuchs endotelial dystrofi (ofte knyttet til en TCF4-repetisjonsekspansjon), TGFBI-relaterte granulær- og gitterdystrofi, og sjeldnere typer forårsaket av gener som SLC4A11, COL8A2, ZEB1 og CHST6.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Bærere av TGFBI-varianter får generelt råd om å unngå laserkirurgi for refraksjonsfeil (LASIK eller PRK), som kan forverre avleiringene. Hornhinnetransplantasjon kan gjenopprette synet ved avansert sykdom.
Slik er PIKFYVE bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 9,9 kb av genets 92,5 kb, og 6 297 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av PIKFYVE
12
posisjoner i PIKFYVE der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 92,5 kb av PIKFYVE, inkludert introner, ikke bare de 9,9 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Deler 1 tilstand
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainDeler 1 tilstand
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainDeler 1 tilstand
- DCNdecorinDeler 1 tilstand
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Deler 1 tilstand
- GSNgelsolinDeler 1 tilstand
- KRT12keratin 12Deler 1 tilstand
- KRT3keratin 3Deler 1 tilstand
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Deler 1 tilstand
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Deler 1 tilstand
- OVOL2ovo like zinc finger 2Deler 1 tilstand
- PRDX3peroxiredoxin 3Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til PIKFYVE
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene PIKFYVE kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). PIKFYVE-genet: phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/pikfyve
Dante Labs. PIKFYVE-genet: phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/pikfyve
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker