Gene
PIKFYVE
phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing
- HGNC 23785↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000115020↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 200576↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 2q34
- Coordinate
- Cromosoma 2: 208.266.255–208.358.746 (GRCh38)
- Esoni
- 42 esoni su 92,5 kb
- Proteina
- 2098 amminoacidi
- Noto anche come
- MGC40423, KIAA0981, PIP5K, p235, ZFYVE29, FAB1
- Simboli precedenti
- PIP5K3
- Trascritto MANE Select
- ENST00000264380.9NM_015040.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Distrofie corneali ereditarie
- Distrofia corneale
Un gruppo di condizioni ereditarie che interessano uno o più strati della cornea, tra cui la distrofia endoteliale di Fuchs (spesso associata a un'espansione di ripetizioni in TCF4), le distrofie granulari e reticolari correlate a TGFBI e tipi più rari causati da geni come SLC4A11, COL8A2, ZEB1 e CHST6.
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Alle persone portatrici di varianti in TGFBI si consiglia generalmente di evitare la chirurgia refrattiva laser (LASIK o PRK), che può peggiorare i depositi; il trapianto di cornea può ripristinare la vista nella malattia avanzata.
Struttura di PIKFYVE
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 9,9 kb dei 92,5 kb del gene; 6297 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge PIKFYVE
12
posizioni in PIKFYVE in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 92,5 kb di PIKFYVE, introni inclusi, non solo i 9,9 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Condivide 1 condizione
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainCondivide 1 condizione
- DCNdecorinCondivide 1 condizione
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Condivide 1 condizione
- GSNgelsolinCondivide 1 condizione
- KRT12keratin 12Condivide 1 condizione
- KRT3keratin 3Condivide 1 condizione
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Condivide 1 condizione
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Condivide 1 condizione
- OVOL2ovo like zinc finger 2Condivide 1 condizione
- PRDX3peroxiredoxin 3Condivide 1 condizione
Tratti collegati a PIKFYVE
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PIKFYVE può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
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Dante Labs. (s.d.). Gene PIKFYVE: phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pikfyve
Dante Labs. Gene PIKFYVE: phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pikfyve
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