Kas yra kitos kartos sekvenavimas?
Kaip šiuolaikiniai prietaisai nuskaito visą genomą, sekvenuodami milijonus trumpų DNR fragmentų vienu metu ir kodėl kiekviena raidė nuskaitoma daug kartų.
5 min. skaitymo
Kai jūsų mėginys atkeliauja į mūsų laboratoriją, prieš sekvenavimą jį reikia paruošti. Mėginio paruošimo (prep) procesas yra žymiai sudėtingesnis nei sekvenavimo etapas. Šio proceso metu taip pat atliekama kokybės kontrolė, kad būtų užtikrinta, jog mėginį galima sėkmingai sekvenuoti.
Jūsų mėginys į mūsų laboratoriją atkeliauja kaip nesuardytos ląstelės: ar tai pilno kraujo ląstelės, kai siunčiate kraujo mėginį, ar skruostų endotelio (odos) ląstelės, kai siunčiate seilių mėginį. Prieš sekvenuodami mėginį atliekame „ekstrakciją“. Šio proceso metu suardoma ląstelės ir branduolio membrana (kur jūsų ląstelėje laikoma DNR), kad DNR laisvai plūduriuotų. Tai būtina, nes membrana ir branduolys abu saugo DNR nuo cheminių įsibrovėlių.
Išskyrę DNR, ją fragmentuojame. Jūsų DNR saugiai laikoma visose chromosomose, kurių ilgis siekia šimtus milijonų bazių, tačiau mūsų sekvenatoriai vienu metu gali nuskaityti tik tūkstančius bazių. Fragmentavimo etape ilgi ruožai suskaidomi į daugybę mažesnių gabalėlių, kurie.