Was ist Next-Generation-Sequenzierung?
Wie moderne Geräte ein ganzes Genom auslesen, indem sie Millionen kurzer DNA-Fragmente gleichzeitig sequenzieren, und warum jeder Buchstabe viele Male gelesen wird.
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Wenn Ihre Probe in unserem Labor eintrifft, müssen wir sie vor der Sequenzierung vorbereiten. Die Probenvorbereitung ist deutlich aufwendiger als der eigentliche Sequenzierschritt. Dabei führen wir außerdem eine Qualitätskontrolle durch, um sicherzustellen, dass sich die Probe erfolgreich sequenzieren lässt.
Ihre Probe kommt als ganze Zellen in unserem Labor an: bei einer Blutprobe als Blutzellen, bei einer Speichelprobe als Wangenzellen (Hautzellen). Bevor wir die Probe sequenzieren können, führen wir eine ‚Extraktion‘ durch. Dabei werden Zell- und Kernmembran aufgelöst, in denen Ihre DNA in der Zelle gespeichert ist, sodass die DNA frei vorliegt. Das ist unerlässlich, denn Membran und Zellkern schützen Ihre DNA vor chemischen Störstoffen.
Nach der Extraktion zerkleinern wir die DNA. Ihre DNA ist als vollständige Chromosomen gespeichert, die aus Hunderten Millionen Basen bestehen. Unsere Sequenziergeräte können jedoch nur Tausende Basen gleichzeitig lesen. Bei der Fragmentierung werden die langen Abschnitte in viele kleinere Stücke zerlegt.