Wat is next-generation sequencing?
Hoe moderne apparaten een volledig genoom lezen door miljoenen korte DNA-fragmenten tegelijk te sequencen, en waarom elke letter vele malen wordt gelezen.
5 min leestijd
Wanneer uw monster in ons laboratorium aankomt, moeten we het voorbereiden voordat we het sequencen. Het voorbereidingsproces (prep) is aanzienlijk uitgebreider dan de sequencingstap. Tijdens dit proces voeren we ook kwaliteitscontrole uit om ervoor te zorgen dat we het monster succesvol kunnen sequencen.
Uw monster komt als volledige cellen bij ons laboratorium aan: bloedcellen wanneer u ons een bloedmonster stuurt, of wang-endotheelcellen (huidcellen) wanneer u ons een speekselmonster stuurt. Voordat we het monster kunnen sequencen, voeren we een 'extractie' uit. Dit proces breekt de cel- en kernmembraan af (waar uw DNA in uw cel is opgeslagen), zodat het DNA vrij kan zweven. Dit is essentieel, omdat het membraan en de kern beide dienen om uw DNA te beschermen tegen chemische indringers.
Zodra we het DNA hebben geëxtraheerd, fragmenteren we het. Uw DNA wordt veilig opgeslagen als volledige chromosomen van honderden miljoenen basen lang, maar onze sequencers kunnen er slechts duizenden tegelijk lezen. Bij de fragmentatiestap worden de lange stukken opgedeeld in meerdere kleinere brokken die