Co je sekvenování nové generace?
Jak moderní přístroje čtou celý genom tak, že současně sekvenují miliony krátkých úseků DNA, a proč je každé písmeno čteno mnohokrát.
5 min čtení
Když váš vzorek dorazí do naší laboratoře, musíme jej před sekvenováním připravit. Příprava vzorku (prep) je podstatně náročnější než samotný krok sekvenování. V průběhu tohoto procesu také provádíme kontrolu kvality, abychom zajistili, že vzorek lze úspěšně sekvenovat.
Váš vzorek k nám do laboratoře dorazí jako celé buňky: ať už jde o celé krevní buňky, pokud nám zašlete vzorek krve, nebo o buňky z tváře (kožní buňky), pokud nám zašlete vzorek slin. Než můžeme vzorek sekvenovat, provedeme „extrakci“. Tento proces rozruší buněčnou a jadernou membránu (kde je vaše DNA uložena v buňce), takže DNA volně plave. To je nezbytné, protože membrána i jádro chrání DNA před chemickými narušiteli.
Jakmile DNA extrahujeme, fragmentujeme ji. Vaše DNA je bezpečně uložena jako celé chromozomy, které mají délku stovek milionů bází, avšak naše sekvenátory dokážou přečíst najednou jen tisíce bází. Fragmentační krok rozdělí dlouhé úseky na několik menších částí, které.