동료 심사 완료 · Biochemical Genetics · 2025
Transcriptome Analysis of TGFBI Knockdown vs Normal Corneal Epithelial Cells: Implications for TGFBI Corneal Dystrophy Treatment
이 연구에서는 shRNA 렌티바이러스 벡터를 사용해 사람 각막 상피세포의 TGFBI 유전자를 녹다운하고, 그에 따른 전사체 변화를 분석했습니다. 70.5%의 녹다운은 염증, 혈관신생, 흉터 형성 및 세포외 기질 리모델링과 관련된 유전자들을 변화시켰으며, 이는 shRNA 치료법이 TGFBI 각막 이영양증의 잠재적 치료법이 될 수 있음을 뒷받침합니다.
Sciriha et al.
이 연구에서는 shRNA 렌티바이러스 벡터를 사용해 사람 각막 상피세포의 TGFBI 유전자를 녹다운하고, 그에 따른 전사체 변화를 분석했습니다. 70.5%의 녹다운은 염증, 혈관신생, 흉터 형성 및 세포외 기질 리모델링과 관련된 유전자들을 변화시켰으며, 이는 shRNA 치료법이 TGFBI 각막 이영양증의 잠재적 치료법이 될 수 있음을 뒷받침합니다.
Dante Labs의 참여 내용
이 연구의 시퀀싱은 Dante Labs가 수행했습니다. 시퀀싱은 이탈리아에 있는 당사 시설에서 Illumina HiSeq2500 플랫폼으로 진행되었으며, 사람 각막 상피세포 배양물 5개(음성 대조군 3개, 스크램블 대조군 2개)와 shRNA TGFBI 녹다운 배양물 3개(shRNA1, 2, 3)에서 얻은 RNA 시퀀싱 라이브러리를 사용했습니다. 논문에 따르면 이 라이브러리는 제조사의 지침에 따라 Illumina TruSeq Stranded mRNA 라이브러리 키트로 제작되었으며, RNA 추출은 연구팀이 Promega ReliaPrep RNA Miniprep System을 사용해 수행했습니다.
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