Revisto por pares · Biochemical Genetics · 2025
Transcriptome Analysis of TGFBI Knockdown vs Normal Corneal Epithelial Cells: Implications for TGFBI Corneal Dystrophy Treatment
O estudo utilizou vetores lentivirais de shRNA para silenciar o gene TGFBI em células epiteliais da córnea humana e caracterizou as alterações resultantes no transcriptoma. Uma redução de 70,5% na expressão alterou genes associados à inflamação, angiogénese, formação de cicatrizes e remodelação da matriz extracelular, sustentando o potencial da terapia com shRNA no tratamento das distrofias corneanas associadas ao TGFBI.
Sciriha et al.
O estudo utilizou vetores lentivirais de shRNA para silenciar o gene TGFBI em células epiteliais da córnea humana e caracterizou as alterações resultantes no transcriptoma. Uma redução de 70,5% na expressão alterou genes associados à inflamação, angiogénese, formação de cicatrizes e remodelação da matriz extracelular, sustentando o potencial da terapia com shRNA no tratamento das distrofias corneanas associadas ao TGFBI.
Participação da Dante Labs
A Dante Labs realizou a sequenciação para este estudo. A sequenciação foi efetuada na plataforma Illumina HiSeq2500, nas nossas instalações em Itália, em bibliotecas de sequenciação de RNA provenientes de cinco culturas de controlo de células epiteliais da córnea humana (três controlos negativos e dois controlos scrambled) e de três culturas com knockdown de TGFBI por shRNA (shRNA1, 2 e 3). O artigo refere que estas bibliotecas foram preparadas com o kit de preparação de bibliotecas Illumina TruSeq Stranded mRNA, de acordo com as instruções do fabricante, e que a extração de RNA foi realizada pela equipa de investigação utilizando o Promega ReliaPrep RNA Miniprep System.
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