Peer-Review · Biochemical Genetics · 2025
Transcriptome Analysis of TGFBI Knockdown vs Normal Corneal Epithelial Cells: Implications for TGFBI Corneal Dystrophy Treatment
In der Studie wurden shRNA-Lentivirusvektoren eingesetzt, um die Expression des TGFBI-Gens in menschlichen Hornhautepithelzellen zu reduzieren und die daraus resultierenden Veränderungen des Transkriptoms zu untersuchen. Eine Reduktion um 70,5 % veränderte die Expression von Genen, die mit Entzündungen, Angiogenese, Narbenbildung und dem Umbau der extrazellulären Matrix zusammenhängen. Dies stützt den Ansatz einer shRNA-Therapie als potenzielle Behandlung für TGFBI-bedingte Hornhautdystrophien.
Sciriha et al.
In der Studie wurden shRNA-Lentivirusvektoren eingesetzt, um die Expression des TGFBI-Gens in menschlichen Hornhautepithelzellen zu reduzieren und die daraus resultierenden Veränderungen des Transkriptoms zu untersuchen. Eine Reduktion um 70,5 % veränderte die Expression von Genen, die mit Entzündungen, Angiogenese, Narbenbildung und dem Umbau der extrazellulären Matrix zusammenhängen. Dies stützt den Ansatz einer shRNA-Therapie als potenzielle Behandlung für TGFBI-bedingte Hornhautdystrophien.
Beteiligung von Dante Labs
Dante Labs führte die Sequenzierung für diese Studie durch. Die Sequenzierung erfolgte auf der Illumina HiSeq2500-Plattform in unserer Einrichtung in Italien. Verwendet wurden RNA-Sequenzierungsbibliotheken aus fünf Kontrollkulturen menschlicher Hornhautepithelzellen (drei Negativkontrollen und zwei Kontrollen mit einer Scrambled-Sequenz) sowie drei shRNA-TGFBI-Knockdown-Kulturen (shRNA1, 2 und 3). Laut der Publikation wurden diese Bibliotheken gemäß den Anweisungen des Herstellers mit dem Illumina TruSeq Stranded mRNA Library Kit erstellt. Die RNA-Extraktion führte das Forschungsteam mit dem Promega ReliaPrep RNA Miniprep System durch.
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