Évalué par les pairs · Biochemical Genetics · 2025
Transcriptome Analysis of TGFBI Knockdown vs Normal Corneal Epithelial Cells: Implications for TGFBI Corneal Dystrophy Treatment
L’étude a utilisé des vecteurs lentiviraux à shRNA pour réduire l’expression du gène TGFBI dans des cellules épithéliales cornéennes humaines et a analysé les modifications du transcriptome qui en ont résulté. Une réduction de 70,5 % de l’expression a modifié des gènes associés à l’inflammation, à l’angiogenèse, à la formation de cicatrices et au remodelage de la matrice extracellulaire, ce qui étaye le potentiel d’un traitement par shRNA contre les dystrophies cornéennes liées à TGFBI.
Sciriha et al.
L’étude a utilisé des vecteurs lentiviraux à shRNA pour réduire l’expression du gène TGFBI dans des cellules épithéliales cornéennes humaines et a analysé les modifications du transcriptome qui en ont résulté. Une réduction de 70,5 % de l’expression a modifié des gènes associés à l’inflammation, à l’angiogenèse, à la formation de cicatrices et au remodelage de la matrice extracellulaire, ce qui étaye le potentiel d’un traitement par shRNA contre les dystrophies cornéennes liées à TGFBI.
Participation de Dante Labs
Dante Labs a réalisé le séquençage pour cette étude. Le séquençage a été effectué sur la plateforme Illumina HiSeq2500 dans nos locaux en Italie, à partir de banques de séquençage de l’ARN provenant de cinq cultures témoins de cellules épithéliales cornéennes humaines (trois témoins négatifs et deux témoins avec séquence aléatoire) et de trois cultures avec extinction de TGFBI par shRNA (shRNA1, 2 et 3). L’article indique que ces banques ont été préparées à l’aide du kit de préparation de banques Illumina TruSeq Stranded mRNA, conformément aux instructions du fabricant, et que l’extraction de l’ARN a été réalisée par l’équipe de recherche à l’aide du Promega ReliaPrep RNA Miniprep System.
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