Sottoposto a revisione paritaria · Biochemical Genetics · 2025
Transcriptome Analysis of TGFBI Knockdown vs Normal Corneal Epithelial Cells: Implications for TGFBI Corneal Dystrophy Treatment
Lo studio ha utilizzato vettori lentivirali shRNA per silenziare il gene TGFBI nelle cellule epiteliali corneali umane e ha analizzato le conseguenti variazioni del trascrittoma. Un silenziamento del 70,5% ha modificato l'espressione di geni associati a infiammazione, angiogenesi, formazione di cicatrici e rimodellamento della matrice extracellulare, avvalorando la terapia con shRNA come potenziale trattamento per le distrofie corneali associate a TGFBI.
Sciriha et al.
Lo studio ha utilizzato vettori lentivirali shRNA per silenziare il gene TGFBI nelle cellule epiteliali corneali umane e ha analizzato le conseguenti variazioni del trascrittoma. Un silenziamento del 70,5% ha modificato l'espressione di geni associati a infiammazione, angiogenesi, formazione di cicatrici e rimodellamento della matrice extracellulare, avvalorando la terapia con shRNA come potenziale trattamento per le distrofie corneali associate a TGFBI.
Il coinvolgimento di Dante Labs
Dante Labs ha eseguito il sequenziamento per questo studio. Il sequenziamento è stato effettuato sulla piattaforma Illumina HiSeq2500 presso la nostra struttura in Italia, utilizzando librerie di sequenziamento dell'RNA provenienti da cinque colture di cellule epiteliali corneali umane di controllo (tre controlli negativi e due controlli scrambled) e tre colture con knockdown di TGFBI mediante shRNA (shRNA1, 2 e 3). L'articolo riporta che queste librerie sono state preparate utilizzando il kit Illumina TruSeq Stranded mRNA secondo le istruzioni del produttore e che l'estrazione dell'RNA è stata eseguita dal team di ricerca utilizzando il Promega ReliaPrep RNA Miniprep System.
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