Gén
NYX
nyctalopin
- HGNC 8082↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000188937↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 60506↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- Xp11.4
- Koordináták
- X. kromoszóma: 41 447 343–41 475 652 (GRCh38)
- Exonok
- 3 exon, összesen 28,3 kb
- Fehérje
- 476 aminosav
- Más néven ismert
- CLRP, CSNB1A
- Korábbi jelölések
- CSNB1, CSNB4
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000378220.3NM_001378477.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nyx.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a NYX-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Congenital Stationary Night Blindness
A group of mostly non-progressive retinal conditions, including Oguchi disease, caused by changes in genes such as NYX, CACNA1F, TRPM1, GRM6, GPR179 and SAG, often with nystagmus or short-sightedness.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
A genetic diagnosis explains the symptoms, helps distinguish the condition from progressive retinal diseases and informs family counselling.
A NYX felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 28,3 kb-jából 2,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1431 bázis kódolja a fehérjét.
NYX szekvenálása
12
a NYX génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a NYX mind a 28,3 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 2,4 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (12)
The NYX variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 7
- Patogén/valószínűleg patogén 1
- Valószínűleg patogén 4
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_001378477.3(NYX):c.70_93del (p.Arg24_Ala31del) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1A | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001378477.3(NYX):c.22+5G>T (opens in a new tab) | inherited retinal dystrophy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.114_139del (p.Cys39fs) (opens in a new tab) | retinal disorder | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.509C>G (p.Pro170Arg) (opens in a new tab) | inherited retinal dystrophy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.689dup (p.Leu231fs) (opens in a new tab) | inherited retinal dystrophy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.880C>T (p.Gln294Ter) (opens in a new tab) | inherited retinal dystrophy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.1054_1055del (p.Val352fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1A | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.1108dup (p.Gln370fs) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1A | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.23-1_23delinsTT (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1A | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.324_338dup (p.Ala113_His114insGluLeuArgLeuAla) (opens in a new tab) | retinal disorder | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.419_420delinsAA (p.Cys140Ter) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1A | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001378477.3(NYX):c.604_612dup (p.Arg202_Arg204dup) (opens in a new tab) | congenital stationary night blindness 1A | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- CABP4calcium binding protein 41 betegséget oszt meg
- CACNA1Fcalcium voltage-gated channel subunit alpha1 F1 betegséget oszt meg
- GNAT1G protein subunit alpha transducin 11 betegséget oszt meg
- GNB3G protein subunit beta 31 betegséget oszt meg
- GPR179G protein-coupled receptor 1791 betegséget oszt meg
- GRK1G protein-coupled receptor kinase 11 betegséget oszt meg
- GRM6glutamate metabotropic receptor 61 betegséget oszt meg
- GUCY2Dguanylate cyclase 2D, retinal1 betegséget oszt meg
- LRIT3leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 31 betegséget oszt meg
- PDE6Bphosphodiesterase 6B1 betegséget oszt meg
- RHOrhodopsin1 betegséget oszt meg
- RIMS2regulating synaptic membrane exocytosis 21 betegséget oszt meg
A(z) NYX génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) NYX gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). NYX gén: nyctalopin. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/nyx
Dante Labs. NYX gén: nyctalopin [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/nyx
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt