Gén
IL6R
interleukin 6 receptor
- HGNC 6019↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000160712↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 3570↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1q21.3
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 154 405 343–154 469 450 (GRCh38)
- Exonok
- 10 exon, összesen 64,1 kb
- Fehérje
- 468 aminosav
- Más néven ismert
- CD126, IL-6R, IL-1Ra, IL6RA, gp80
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000368485.8NM_000565.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/il6r.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a IL6R-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Hyper-IgE Syndrome
A condition that is characterized by elevated serum IgE, dermatitis, and respiratory infections.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
A 114 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Immunodeficiency Disease
A 170 hozzá kapcsolódó gén egyike
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
A IL6R felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 64,1 kb-jából 5,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1407 bázis kódolja a fehérjét.
IL6R szekvenálása
4Könnyű
Mennyire nehéz a IL6R szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A IL6R exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a IL6R exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.4,8%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.13%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a IL6R exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- DOCK8dedicator of cytokinesis 83 betegséget oszt meg
- IL6STinterleukin 6 cytokine family signal transducer3 betegséget oszt meg
- SPINK5serine peptidase inhibitor Kazal type 53 betegséget oszt meg
- STAT3signal transducer and activator of transcription 33 betegséget oszt meg
- STAT6signal transducer and activator of transcription 63 betegséget oszt meg
- ZNF341zinc finger protein 3413 betegséget oszt meg
- AICDAactivation induced cytidine deaminase2 betegséget oszt meg
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 12 betegséget oszt meg
- BCL10BCL10 immune signaling adaptor2 betegséget oszt meg
- BCL11BBCL11 transcription factor B2 betegséget oszt meg
- BLNKB cell linker2 betegséget oszt meg
- BTKBruton tyrosine kinase2 betegséget oszt meg
A(z) IL6R génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) IL6R gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). IL6R gén: interleukin 6 receptor. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/il6r
Dante Labs. IL6R gén: interleukin 6 receptor [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/il6r
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt