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Gène

PDCD10

programmed cell death 10

Résumé

Localisation cytogénétique
3q26.1
Coordonnées
Chromosome 3 : 167 683 298–167 734 892 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 51,6 kb
Protéine
212 acides aminés
Hérédité
Autosomique dominant
Aussi appelé
TFAR15
Symboles précédents
CCM3
Transcrit MANE Select
ENST00000392750.7NM_007217.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

  • Malformation caverneuse cérébrale

    • Malformation caverneuse cérébrale 3Autosomique dominant

      Toute malformation caverneuse cérébrale familiale dont la cause est une mutation dans le gène PDCD10.

      • 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort

Transmission

Autosomique dominant
Une copie modifiée, provenant de l'un ou l'autre parent, suffit. Un parent qui en porte une la transmet à chacun de ses enfants avec une probabilité de une sur deux.

Structure de PDCD10

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de PDCD10. PDCD10 et 5 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 167 209 095 à 168 209 094.Chromosome 33q26.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29167,4 Mb167,6 Mb167,8 Mb168 Mb168,2 MbZBBX : 167 239 843–167 407 874, brin inverseZBBXSERPINI2 : 167 438 967–167 478 972, brin inverseSERPINI2WDR49 : 167 477 789–167 653 983, brin inverseWDR49PDCD10 : 167 683 298–167 734 892, brin inversePDCD10SERPINI1 : 167 735 065–167 828 461, brin directSERPINI1GOLIM4 : 168 008 552–168 096 536, brin inverseGOLIM4Schéma de PDCD10 : 9 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 9 : 5 sites connus associés à une maladieExon 8 : 5 sites connus associés à une maladieExon 7 : 5 sites connus associés à une maladieExon 6 : 9 sites connus associés à une maladieExon 5 : 10 sites connus associés à une maladieExon 4 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 6 sites connus associés à une maladieExon 9 : 167 683 298–167 684 389, 1 092 basesExon 8 : 167 687 234–167 687 316, 83 basesExon 7 : 167 687 615–167 687 693, 79 basesExon 6 : 167 695 596–167 695 722, 127 basesExon 5 : 167 697 009–167 697 126, 118 basesExon 4 : 167 704 842–167 704 895, 54 basesExon 3 : 167 720 062–167 720 273, 212 basesExon 2 : 167 734 214–167 734 350, 137 basesExon 1 : 167 734 662–167 734 892, 231 bases9515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,1 kb sur les 51,6 kb du gène ; 639 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit PDCD10

51

positions dans PDCD10 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 51,6 kb de PDCD10, introns compris, et pas seulement les 2,1 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PDCD10 : programmed cell death 10. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pdcd10

Vancouver

Dante Labs. Gène PDCD10 : programmed cell death 10 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pdcd10

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